[发明专利]一种用于分析体液蛋白质组的方法在审
申请号: | 202180009343.2 | 申请日: | 2021-11-09 |
公开(公告)号: | CN115004023A | 公开(公告)日: | 2022-09-02 |
发明(设计)人: | 成晓亮;周岳;张伟;郑可嘉 | 申请(专利权)人: | 江苏品生医疗科技集团有限公司;南京品生医疗科技有限公司 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/72;G01N30/86;G01N33/68 |
代理公司: | 成都七星天知识产权代理有限公司 51253 | 代理人: | 谭美琳 |
地址: | 210061 江苏省南京市浦口区智*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 分析 体液 蛋白质 方法 | ||
1.一种用于分析体液蛋白质组的方法,包括:
采用亲和技术去除初始样品A中的高丰度蛋白,获得低丰度蛋白富集的待测样品I;
采用化学沉淀法去除初始样品B中的高丰度蛋白,获得低丰度蛋白富集的待测样品II,其中所述初始样品A和所述初始样品B来自同一受试者的同一份体液样品;
对所述待测样品I进行蛋白质组学分析,获得蛋白质组数据集I;
对所述待测样品II进行蛋白质组学分析,获得蛋白质组数据集II;
基于所述蛋白质组数据集I和所述蛋白质组数据集II,确定所述体液样品最终定量的蛋白质组数据集。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,对所述待测样品I进行蛋白质组学分析包括:使用数据非依赖性采集技术对所述待测样品I进行定量蛋白质组学分析。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,对所述待测样品II进行蛋白质组学分析包括:使用数据非依赖性采集技术对所述待测样品II进行定量蛋白质组学分析。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述体液包括血浆、血清、尿液、组织液、胸膜腔内液体、腹腔内的液体、脑脊液、精液和阴道液体中的一种或多种。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述采用亲和技术去除初始样品A中的高丰度蛋白包括:利用所述高丰度蛋白的抗体作为亲和配体去除所述高丰度蛋白。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其中,所述高丰度蛋白包括白蛋白、IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、α1-酸性糖蛋白、α1-抗胰蛋白酶、α2-巨球蛋白、载脂蛋白A1、纤维蛋白原、触珠蛋白、转铁蛋白、补体C3、载脂蛋白A-II、α-2-HS-糖蛋白、载脂蛋白C-III、α-1-抗胰凝乳蛋白酶、维生素D结合蛋白、铜蓝蛋白、补体C4-A、补体C1q、血凝素、激肽原-1、突触结合蛋白5、富含组氨酸的糖蛋白、玻连蛋白、补体因子H、血浆蛋白酶C1抑制剂、C4b结合蛋白、纤连蛋白中的一种或多种。
7.根据权利要求5所述的方法,其中,所述高丰度蛋白的抗体被固定化至固相载体上。
8.根据权利要求7所述的方法,其中,所述固相载体包括纤维素、聚丙稀酰胺、聚苯乙烯、聚乙烯、聚丙烯、交联葡聚糖、玻璃、硅橡胶、琼脂糖凝胶和凝胶树脂中的一种或多种。
9.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其中,所述采用亲和技术去除初始样品A中的高丰度蛋白和/或所述采用化学沉淀法去除初始样品B中的高丰度蛋白在多腔体容器中进行。
10.根据权利要求1所述的方法,其中,所述采用化学沉淀法去除初始样品B中的高丰度蛋白包括:利用有机溶剂作为沉淀剂使所述高丰度蛋白沉淀。
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述有机溶剂包括甲醇、乙醇、异丙醇、乙腈、氯仿、三氯乙酸、三氟乙酸中的一种或多种。
12.根据权利要求10所述的方法,其中,所述采用化学沉淀法去除初始样品B中的高丰度蛋白还包括:在利用所述沉淀剂使所述高丰度蛋白沉淀之前,使用变性剂使所述高丰度蛋白质变性。
13.根据权利要求12所述的方法,其中,所述变性剂包括盐酸胍、尿素中的一种或多种。
14.根据权利要求2所述的方法,其中,所述待测样品I经还原、烷基化、酶切和脱盐后,获得用于使用数据非依赖性采集技术进行蛋白质组学分析的肽段集合I。
15.根据权利要求2所述的方法,其中,所述待测样品II经脱盐、还原、烷基化和酶切后,获得用于使用数据非依赖性采集技术进行蛋白质组学分析的肽段集合II。
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