[发明专利]类风湿性关节炎标志KO及其应用在审
| 申请号: | 202111672795.7 | 申请日: | 2021-12-31 |
| 公开(公告)号: | CN114317718A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
| 发明(设计)人: | 郑智俊;朱剑梅;张笑笑 | 申请(专利权)人: | 上海锐翌生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;G16B25/20;G16B30/10;G16B30/20;G16B50/00 |
| 代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 黄德海 |
| 地址: | 201114 上海市闵行区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 类风湿性关节炎 标志 ko 及其 应用 | ||
1.一种试剂盒,其特征在于,包括适于检测第一基因簇集合中至少一个基因簇的试剂,所述第一基因簇集合由K00561、K00663、K01154、K02902、K02909、K07770、K10819和K18220组成。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,进一步包括适于检测第二基因簇集合中至少一个基因簇的试剂,所述第二基因簇集合由K00088、K00800、K00873、K00941、K00951、K01752、K01925、K01933、K01937、K01945、K02109、K02112、K02314、K03177、K04485和K13038组成。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,包括适于检测全部所述第一基因簇集合的试剂。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,包括适于检测全部所述第二基因簇集合的试剂。
5.试剂在制备试剂盒中的用途,所述试剂适于检测第一基因簇集合中的至少一个基因簇,所述试剂盒用于诊断类风湿性关节炎或者检测类风湿性关节炎的治疗效果,所述第一基因簇集合由K00561、K00663、K01154、K02902、K02909、K07770、K10819和K18220组成。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述试剂进一步适于检测第二基因簇集合中的至少一个基因簇,所述第二基因簇集合由K00088、K00800、K00873、K00941、K00951、K01752、K01925、K01933、K01937、K01945、K02109、K02112、K02314、K03177、K04485和K13038组成。
7.一种用于预防或者治疗类风湿性关节炎的药物组合物或者食品组合物,其特征在于,含有提高第二基因簇集合中的至少一个基因簇的丰度的物质,所述第二基因簇集合由K00088、K00800、K00873、K00941、K00951、K01752、K01925、K01933、K01937、K01945、K02109、K02112、K02314、K03177、K04485和K13038组成。
8.一种确定个体是否患有类风湿性关节炎的方法,其特征在于,包括:
(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因簇的丰度,所述标志基因簇包括第一基因簇集合和第二基因簇集合中的至少一个基因簇;
(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较,以便确定所述个体是否患有类风湿性关节炎;
其中,所述第一基因簇集合由K00561、K00663、K01154、K02902、K02909、K07770、K10819和K18220组成;
所述第二基因簇集合由K00088、K00800、K00873、K00941、K00951、K01752、K01925、K01933、K01937、K01945、K02109、K02112、K02314、K03177、K04485和K13038组成。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(1)进一步包括:
获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据;
将所述测序数据与参考基因组进行比对;
基于所述比对的结果,确定基因的丰度;
基于所述基因的丰度,确定所述标志基因簇的丰度。
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