[发明专利]一个由禾谷镰孢引起的玉米穗腐病抗性主效QTL及其连锁的分子标记

说明书

本发明公开了一个由禾谷镰孢引起的玉米穗腐病抗性主效QTL及其连锁的分子标记。玉米抗穗腐病的主效QTL位点，位于玉米7号染色体7.01‑7.02bins上约3.33Mb的物理区间内，该主效QTL能解释14.09‑15.70％的表型变异率。有2个SNP分子标记与之紧密连锁，分别是Zyg7485和Zyg7518。本发明所述的玉米穗腐病抗性主效QTL及其连锁的分子标记在筛选或鉴定抗穗腐病玉米品种中的应用。本发明有助于克服玉米抗病育种工作中对穗腐病抗性的鉴定存在成本高、时间长等特点，大大加快我国高抗穗腐病玉米新品种的培育与产业化进程。

技术领域

本发明属于作物遗传育种领域，涉及一种禾谷镰孢引起的玉米穗腐病抗性主效QTL及其连锁的SNP分子标记。

背景技术

近几年玉米穗腐病病原菌的鉴定结果表明，拟轮枝镰孢和禾谷镰孢是国内穗腐病的主要优势病原菌。另外，拟轮枝镰孢一般由害虫如玉米螟等叮咬所致的局部伤口开始侵染导致籽粒腐烂，通常发病籽粒上附着白色霉层；而禾谷镰孢一般通过花丝通道开始侵染，通常发病籽粒上附着浅粉色至粉色霉层，所以多会造成原发性的果穗(包括穗轴)大面积腐烂，产量损失及危害性更大。

玉米穗腐病是一种在全世界广泛发生且危害严重的真菌性病害，一般年份玉米穗腐病的发病率为10％-20％，严重年份可达30％-40％，感病品种的发病率高达50％左右，而且其发病程度逐年加重。玉米穗腐病不仅会引起果穗腐烂而导致直接减产，而且有些病原菌还会产生大量的有害毒素，严重威胁人类和动物的健康和生命安全。另外，玉米籽粒直收已经成为玉米育种的方向，而籽粒直收过程中，无法对发生穗腐病的果穗进行剔除，因此，机械化的不断推进，将会对玉米品种穗腐病抗病方面的要求变得更为严苛。现有的对玉米穗腐病的防治措施，如喷施杀菌剂、翻耕、间混作等，效果均不理想，而最经济有效的防治途径就是培育和推广抗病品种。然而，目前还没有可以直接用于分子育种的遗传稳定的QTL或者基因被报道。

由于目前玉米育种上应用的自交系大多缺少对穗腐病的抗性，以致我国玉米穗腐病的抗性形势非常严峻，亟需提高。筛选抗病自交系、选育抗病品种是控制和预防玉米穗腐病的最根本和最有效的措施。因此，进行玉米抗穗腐病数量性状位点的定位，挖掘相应的抗病基因，利用分子标记辅助育种和生物技术育种等提高玉米对穗腐病的抗性至关重要。

发明内容

本发明的目的是提供一个新的玉米高抗穗腐病的主效QTL位点及其相关联的分子标记和应用。

本发明要求保护一种与玉米穗腐病抗性相关的主效QTL-qRger7.2相连锁的分子标记在鉴定或辅助鉴定玉米穗腐病抗性中的应用，所述分子标记为Zyg7485和Zyg7518，所述分子标记Zyg7485为是玉米基因组的一个SNP位点，分子标记Zyg7485位于玉米基因组7号染色体上SEQ ID No.1的第151位核苷酸，其为T或C(如附图1所示)；所述分子标记Zyg7518为是玉米基因组的一个SNP位点，分子标记Zyg7518位于玉米基因组7号染色体上SEQ IDNo.2的第151位核苷酸，其为A或C(如附图2所示)。

所述的分子标记Zyg7485和Zyg7518在如下任一中的应用也应在本发明的保护范围之内：

1)玉米育种中的应用；

2)筛选或鉴定抗穗腐病玉米品种中的应用；

3)筛选或鉴定玉米抗穗腐病的主效QTL-qRger7.2中的应用。

检测玉米基因组中分子标记Zyg7485的多态性或基因型的物质和/或检测玉米基因组中分子标记Zyg7518的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米穗腐病抗性的产品中的应用也应在本发明的保护范围之内。

所述检测玉米基因组中分子标记Zyg7485的多态性或基因型的物质为扩增包括Zyg7485在内的玉米基因组DNA片段的引物对；