[发明专利]一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法在审
| 申请号: | 202111663245.9 | 申请日: | 2021-12-31 |
| 公开(公告)号: | CN114332462A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
| 发明(设计)人: | 黄立勤;庄炜杰 | 申请(专利权)人: | 福州大学 |
| 主分类号: | G06V10/26 | 分类号: | G06V10/26;G06V10/44;G06V10/774;G06V10/82;G06N3/04;G06N3/08;G06K9/62 |
| 代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 郭东亮;蔡学俊 |
| 地址: | 362251 福建省泉州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 针对 大脑 病变 融入 注意力 机制 mri 分割 方法 | ||
1.一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法,其特征在于:包括以下步骤;
步骤S1、收集有分割图结果的大脑MRI图像,建立训练集;
步骤S2、对训练集中待分割的原始大脑MRI图像进行预处理;
步骤S3、建立带有注意力机制的卷积神经网络,并以训练集对其模型进行训练;
步骤S4、当模型训练完成后,使用训练好的模型参数对验证集图像进行预测,并且生成大脑MRI组织与病变分割图;
步骤S5、建立评估文件,评估分割结果。
2.根据权利要求1所述的一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法,其特征在于:在步骤S1中,使用包含大脑正常组织和病变组织的MRBRains18数据集,所述MRBRains18数据集的MRI图像包含T1、T2和Flair三种模态;在步骤S1中,对大脑MRI图像进行颅骨剥离处理。
3.根据权利要求2所述的一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法,其特征在于:在步骤S2中以预处理来优化组织与病变分割结果,包括以下步骤;
步骤A1、针对T1图像,通过直方图均衡化处理,来增加图像中大脑组织尤其是灰质白质的对比度;
步骤A2、将3个连续切片堆叠为RGB图像,使3个切片的每个2D彩色图像形成类似3D表示的MR体积的一部分;
步骤A3、进行数据增强,其数据增强策略包括图像缩放和图像旋转。
4.根据权利要求2所述的一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法,其特征在于:所述步骤S3中,建立带有注意力机制的2D卷积神经网络,所述注意力机制结合空间注意力、通道注意力并形成对应的模块,其方法如下:
首先通过输入特征图F(H*W*C),计算出一个通道注意力模块,其中H为高度、W为宽度、C为通道数;接着,分别传进一个两层的神经网络MLP,即多层感知器,该多层感知器是共享的;然后按照通道顺序乘以这个模块;然后继续计算出空间注意力模块,继续按照宽高维度乘以这个模块,最后输出经过调整的特征图;所述空间注意力模块与通道注意力模块经完整训练后,用于提取出不同例子的白质病变特征以及位置,优化不规则的白质病变的分割结果。
5.根据权利要求4所述的一种针对大脑病变融入注意力机制的MRI分割方法,其特征在于:所述步骤S3中,建立带有注意力机制的2D卷积神经网络时,首先进行通道注意力的处理,具体步骤为:将输入的特征图F=(H*W*C)分别经过基于宽和高的全局最大池化与全局平均池化,得到两个1*1*C的特征图,接着,分别传进一个两层的神经网络(MLP),也就是多层感知器;所述多层感知器是共享的;然后将多层感知器输出的特征进行基于元素求和操作,再经过sigmoid函数激活操作,生成最终的通道注意力,即Mc;最后,将Mc和输入特征图F做元素乘法操作,生成空间注意力模块需要的输入特征,计算公式如下
其中,σ代表sigmoid函数,表示平均池化特征,表示最大池化特征,W1,W0代表着两个多层感知器的权重,输入进来多层感知器的和共享这两个权重,以提高模型泛化能力;
然后将通道注意力模块输出的特征图F'作为空间注意力模块的输入特征图;空间注意力模块的相关步骤为:首先做一个基于通道的全局最大池化与全局平均池化,得到两个H*W*1的特征图,然后将这两个特征图基于通道做拼接操作;然后经过一个7×7卷积降维为1个通道,即H*W*1;再经过sigmoid生成空间注意力,即Ms;最后将Ms和该模块的输入图做乘法,得到最终生成的特征;空间注意力计算公式如下:
f7*7表示一个7×7卷积核的卷积运算。
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