[发明专利]一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法在审
| 申请号： | 202111641027.5 | 申请日： | 2021-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN114277176A | 公开（公告）日： | 2022-04-05 |
| 发明（设计）人： | 张晓宇;高振峰;王丽英;张立新;张新宪;侯亚茹 | 申请（专利权）人： | 山西农业大学食品科学与工程学院（山西省农业科学院农产品贮藏保鲜研究所） |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京睿智保诚专利代理事务所(普通合伙) 11732 | 代理人： | 周新楣 |
| 地址： | 030031 *** | 国省代码： | 山西;14 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 利用 通量 分析 玉露香梨 贮藏 期间 果实 群落 结构 方法 | ||
1.一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)将玉露香梨贮藏，每隔28～32d取样一次，共取样3～5次，得不同的玉露香梨样本；
(2)分别提取上述不同玉露香梨样本的微生物组总DNA，对所述微生物组总DNA进行PCR扩增，得PCR扩增产物；
(3)用上述所得的PCR扩增产物构建测序文库；
(4)对上述测序文库进行高通量测序，对测序数据进行OTU统计获得玉露香梨贮藏期间果实的菌群落结构。
2.根据权利要求1所述一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法，其特征在于，步骤(1)中所述贮藏的温度为-2～2℃，所述贮藏的湿度为80～90％。
3.根据权利要求1或2所述一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法，其特征在于，步骤(2)中所述PCR扩增的体系为DNA 3～5μL，正向引物1～3μL，反向引物1～3μL，Premix Tap 24～26μL和ddH2O 16～18μL，所述正向引物序列如SEQ IDNO.1所示，所述反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。
4.根据权利要求3所述一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法，其特征在于，步骤(2)中所述PCR扩增的条件为93～95℃预变性4～6min，93～95℃变性50～60s，45～55℃退火45～55s，70～75℃延伸50～60s，循环30～35次，70～75℃延伸8～12min。
5.根据权利要求1所述一种利用高通量测序分析玉露香梨贮藏期间果实菌群落结构的方法，其特征在于，步骤(4)所述高通量测序过程中，目的片段的长度为200～500bp。
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