[发明专利]一种肝癌筛查血清生物标志物群及其应用在审
| 申请号: | 202111623320.9 | 申请日: | 2021-12-28 |
| 公开(公告)号: | CN114371296A | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
| 发明(设计)人: | 申华莉;胡安琪;张磊 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
| 主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N27/62;G16B5/00;G16B40/10;G16B20/00 |
| 代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 褚明伟 |
| 地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 肝癌 血清 生物 标志 及其 应用 | ||
本发明涉及一种肝癌筛查血清生物标志物群及其应用。本发明采用t检验和SVM built‑in算法筛选蛋白质质谱定量的肝癌相关的蛋白质组合,结合机器学习中的线性支持向量机(Linear SVM)模型利用所选的蛋白组合对肝癌患者和正常人进行精准分类,可弥补临床上基于甲胎蛋白(肝癌诊断标志物)的筛查方法灵敏度和特异性不足的缺点。同时可以作为辅助手段结合临床其他检查结果进行进一步临床决策,实现肝癌早发现、早诊断和早治疗,大大改善患者的预后。
技术领域
本发明属于蛋白质组学技术领域,尤其是涉及一种肝癌筛查血清生物标志物群及其应用。
背景技术
肝癌是对各种组织学上不同类型的原发性肝脏肿瘤的统称,其中肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)占绝大部分(90%)。肝癌由于预后差、死亡率高、不易诊断等特征,也常被成为“癌中之王”。据统计,全球每年约有70万例左右的新发肝癌病人,其中35万例以上在中国。虽然手术治疗在早期可能是有效的,但5年总生存率只有50-70%。肝硬化的发展促进了一系列的遗传或表观遗传的改变,导致发育不良结节的形成,使其成为肝癌的癌前阶段。因此,肝癌的早期诊断有助于改善预后。
目前,临床上常用的肝癌诊断标志物为甲胎蛋白(AFP)。然而甲胎蛋白筛查肝癌的灵敏度和特异性并不十分理想,血清AFP在妊娠期妇女、生殖系胚胎源性肿瘤、胃肠道恶性肿瘤和急慢性肝炎肝硬化人群中也可能出现不同程度的升高。并且,临床上有30%的患者AFP不会升高,呈现阴性。近年关于肝癌血清标志物的研究也发现了一些有价值的标志物,例如血清骨桥蛋白(OPN),异常凝血酶原(PIVKA-II)等,但尚未在临床广泛应用及得到认可。因此,寻找灵敏度和特异性均高的肝癌筛查方法成为临床研究的重点和难点。
蛋白质组学是近年来兴起的一种新的生物研究手段,是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质表达水平,翻译后修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上正常与疾病状态下的差异,从而进行疾病的早期诊断及鉴别。蛋白质质谱是一种通过鉴定、定量蛋白质来寻找生物标志物的有效手段,具有同时检测数千种蛋白质和翻译后修饰的能力,因此从根本上改变了对生物系统的研究方式。几十年来,质谱在测量速度、灵敏度和准确性方面都得到了极大的提高,再次推动了定量蛋白质组学的发展。然而如何利用蛋白质质谱精准对肝癌进行筛查依旧是行业亟待解决的一大难题。
发明内容
基于现有技术中缺乏利用蛋白质质谱对肝癌进行精准筛查的现状,本发明提供一种肝癌筛查血清生物标志物群及其应用。
本发明的目的可以通过以下技术方案来实现:
本发明首先提供一种肝癌筛查血清生物标志物群,选自以下蛋白中的5种或5种以上的组合:
PZP,SPP2,APOM,HPR,C9,IGFALS,SERPIND1,HRG,C6,SAA4,C4BPA,KLKB1,VWF,APOA2,BST1,F13B,APOA1,APOA4,MST1,KNG1,IGHA1,APOC2,C1R,ITIH2,FBLN1,PF4,HPX,PPBP,ITIH1,GC,ALAD,FCGR3A,IGHV3-7,F10,CST3,TTR,FN1,APCS,TF,F2,CFB,PTGDS,APOL1,FETUB,THBS1,IGKV1-17,AHSG,SERPINF2,MPO,PLG,MCAM,SERPINF1,CFI,FGB,FGG,A2M,IGHV3-9,FGA,APOC1,IL1RAP,ICAM2,SRGN,MAN1A1,COMP,CPB2,AGT,SERPING1,COLEC10,IGLL5;
在本发明的一个实施方式中,所述肝癌筛查血清生物标志物群选择为以下所有蛋白的组合:
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