[发明专利]一组神经胶质瘤鉴别标志物及应用在审
申请号: | 202111614720.3 | 申请日: | 2021-12-27 |
公开(公告)号: | CN116397022A | 公开(公告)日: | 2023-07-07 |
发明(设计)人: | 刘春芳;马展 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200040 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 神经 胶质 鉴别 标志 应用 | ||
本发明属生物和医学检验领域,涉及一组用于神经胶质瘤鉴别的肿瘤标志物及应用;所涉及的基因包括:SMOC1、BCAN、DLL3、TCF12、KLRC2、SOX8、OLIG2、NKAIN4、LHFPL3、BEST3、LUZP2、P2RY12、GALNT13、FLJ16779、SHD、PTPRZ1、RND2、FAM181B、CHI3L1、C21orf62、AC015936.3、RP11‑698N11.2、RP11‑35N6.1、LINC01094、LINC00836、RP11‑403A3.3、RP11‑277P12.6等27个基因。所述单独(PTPRZ1除外)或任意组合基因产物(蛋白、RNA)表达量差异,可用于鉴别神经胶质瘤。该标志物的组合在正常脑组织与神经胶质瘤的鉴别中,在特异性为90%时,灵敏度可达90%以上。
技术领域
本发明属生物和医学检验领域,涉及一组用于神经胶质瘤鉴别的肿瘤标志物及应用;所涉及的基因包括:SMOC1、BCAN、DLL3、TCF12、KLRC2、SOX8、OLIG2、NKAIN4、LHFPL3、BEST3、LUZP2、P2RY12、GALNT13、FLJ16779、SHD、PTPRZ1、RND2、FAM181B、CHI3L1、C21orf62、AC015936.3、RP11-698N11.2、RP11-35N6.1、LINC01094、LINC00836、RP11-403A3.3、RP11-277P12.6等27个基因。所述基因产物(蛋白、RNA)表达量改变可作为神经胶质瘤鉴别的标志物,从而有利于建立神经胶质瘤鉴别的高通量、客观的分子检测方法。
背景技术
神经胶质瘤(Glioma)是对人类健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一,按病理形态学特征WHO将神经胶质瘤分为:WHO II、WHO III、WHO IV(胶质母细胞瘤,GBM)三型[1,2]。颅内肿瘤除神经胶质瘤外,还涉及到从别的部位转移至颅内的肿瘤。基于颅内原发性肿瘤还是转移性肿瘤,临床上采用的手术方案存在着巨大差异。因此,如果能快速鉴别颅内肿瘤是否为胶质瘤具有重要的价值。病理诊断是神经胶质瘤鉴别的金标准,但病理诊断具有诊断耗时长、具有主观性、难以实现高通量等劣势。如果能建立神经胶质瘤的快速检测方法,可以辅助病理诊断,更好地服务于临床。
分子生物学技术具有快速、微量、高通量、客观等巨大优势。因而,用分子生物学方法对神经胶质瘤进行快速鉴别是未来的发展方向。但用于神经胶质瘤鉴别的有效标志物还有待进一步发掘。
生物信息学的目的是通过开放数据库,加快人类对肿瘤的认识,早日攻克肿瘤,造福于人类。在本发明中,我们利用“The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库研究”和GTExdata两个生物信息数据库;通过大规模筛查,我们找到一组神经胶质瘤特异性标志物,包括SMOC1、BCAN、DLL3、TCF12、KLRC2、SOX8、OLIG2、NKAIN4、LHFPL3、BEST3、LUZP2、P2RY12、GALNT13、FLJ16779、SHD、PTPRZ1、RND2、FAM181B、CHI3L1、C21orf62、AC015936.3、RP11-698N11.2、RP11-35N6.1、LINC01094、LINC00836、RP11-403A3.3、RP11-277P12.6等27个基因。与正常脑组织及颅外的肿瘤组织相比,所述基因表达产物(RNA,蛋白)中一些基因在神经胶质瘤组织中极度增高;可用于神经胶质瘤与正常脑组织及颅外的肿瘤组织进行鉴别。
基于现有技术的研究基础与现状,本申请的发明人拟提供一组用于神经胶质瘤鉴别的肿瘤标志物。本发明涉及通过所述基因组(单个或二种及以上任意组合)在神经胶质瘤组织中的表达量增高,来辅助神经胶质瘤鉴别。尤其是通过多种肿瘤标志物联合形成阵列,再与提取、检测神经胶质瘤组织中蛋白质(如免疫比浊、胶体金、免疫化学发光等)或RNA(如RT-PCR、荧光定量PCR、RNA array、RNA Sequencing等)相结合,可以为神经胶质瘤鉴别提供一种高通量、快速、有效、客观的方法。
发明内容
本发明的目的在于为“神经胶质瘤的快速鉴别”提供一组标志物。
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