[发明专利]核酸产品和用于α-地中海贫血单体型分析的试剂盒

说明书

本发明涉及一种核酸产品和用于α‑地中海贫血单体型分析的试剂盒。该核酸产品包括十组引物对，对应地扩增以下十个STR位点：D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423。利用上述核酸产品对α‑地中海贫血单体型分析的成功率和准确率高、能对目标突变位点进行分析且能发现新发突变。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种核酸产品和用于α-地中海贫血单体型分析的试剂盒。

背景技术

α-地中海贫血(简称α-地贫)是一种常见的单基因遗传病，主要是由于α-珠蛋白基因上的改变引发血红蛋白合成障碍从而引起的慢性进行性加重溶血性贫血。α地贫是地中海贫血的一种常见类型，属于常染色体不完全显性遗传疾病。

目前预防和控制地中海贫血的诊断方法包括产前诊断和胚胎植入前遗传学诊断(PGD)。前者是在不同孕周进行绒毛膜取绒毛或羊膜腔穿刺抽取羊水或脐带血等方法对已孕胚胎进行基因诊断，而PGD是将常规产前诊断提早到胚胎于子宫着床之前进行活检和遗传学分析，选择无遗传性疾病的胚胎植入子宫腔内，从而获得正常胎儿的诊断方法。

临床上在进行α-地贫PGD时会容易导致误诊，故在进行α-地贫PGD时常加入上下游的单核苷酸多态性(SNP)或者短串联重复序列(STR)位点作为遗传标记，进行连锁分析从而降低等位基因脱扣(ADO)和污染引起的误诊率。

目前应用于α-地贫PGD单体型分析的方法主要是基于二代测序(NGS)的SNP单体型分析技术。SNP单体型分析技术是对发育至第5天或者第6天的囊胚行活检，对活检细胞进行全基因组扩增，将致病基因突变作为目标区域，在该基因突变上下游选择数十至上百个单核苷酸多态性位点作为连锁遗传标记，通过二代测序技术进行胚胎植入前单体型分析和染色体非整倍体筛查。

基于二代测序的SNP单体型分析技术虽然能用于连锁分析的位点通常为数十至上百个，可提供更准确、更全面的信息，但对于α-地中海贫血单体型分析而言，其可用于分型的SNP位点数目少，杂合度低，且容易发生等位基因脱扣现象，对于分型的成功率及准确性无法保障，且其操作需要经文库构建和高通量测序，步骤繁琐、成本高、数据分析时间长，不易临床推广。

发明内容

基于此，有必要提供一种核酸产品及用于α-地中海贫血单体型分析的试剂盒，利用该核酸产品对α-地中海贫血单体型分析，成功率和准确率高。

一种核酸产品，包括十组引物对，所述十组引物对用于对应地扩增以下十个STR位点：D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423。

经本申请研究发现，D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423这十个STR位点具有高度多态性，用于α-地中海贫血的单体型分析(例如胚胎植入前的α-地中海贫血的单体型分析)时，每个家系至少有四个有效STR位点，并且分析的准确率高，成本低。此外，通过上述STR位点进行单体型分析结合家系基因型信息，还可以对胚胎样本进行植入前遗传学诊断。。