[发明专利]一种甘薯花青素相关SNP分子标记、鉴定及其应用

权利要求书

1.一种甘薯花青素相关SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记上存在SNP位点chr12.20497784，基因型为GG，GA，AA。

2.根据权利要求1所述的甘薯花青素相关SNP分子标记，其特征在于，所述基因型为GG时，薯块不含有花青素；所述基因型为GA或者AA，薯块含有花青素。

3.根据权利要求1所述的甘薯花青素相关SNP分子标记，其特征在于，所述SNP位点基因分型检测中，涉及PCR扩增反应；PCR扩增反应中扩增引物P1、P2的核苷酸序列分别为SEQ IDNO.1 、SEQ ID NO.2所示。

4.根据权利要求1所述的甘薯花青素相关SNP分子标记，其特征在于，所述SNP位点检测中，涉及单碱基延伸反应；单碱基延伸反应中延伸引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

5.一种利用权利要求1-4任一项所述的SNP位点鉴定甘薯的薯块中是否含有花青素的方法，其特征在于，所述方法包括检测SNP位点chr12.20497784，以确定待检测甘薯该SNP位点处的基因型为GG，GA或AA；所述基因型为GG时，薯块不含有花青素；所述基因型为GA或者AA，薯块含有花青素。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，具体包括以下步骤：

（1）将提取的DNA样品稀释至20ng/μl后作为PCR模板，进行单一扩增；

（2）将扩增好的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳，300V电压下12分钟，获取鉴定胶图，通过胶图确定目的条带大小，将PCR产物进行纯化；

（3）纯化好的单一PCR产物待用，单碱基延伸引物稀释到10μM，进行SNaPshot PCR；

（4）纯化好的混合PCR产物待用，单碱基延伸引物稀释到10μM，将各位点的等体积单碱基延伸引物混合，得到Pooled Primers，进行SNaPshot PCR，

（5）进行毛细管检测。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤（1）中，所述扩增体系及各组分如下：

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8.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤（3）中，所述PCR体系及各组分如下：

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9.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤（4）中，所述PCR体系及各组分如下：

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10.一种如权利要求1-4任一项所述的甘薯花青素相关SNP分子标记在甘薯育种中的应用。