[发明专利]一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记和选育方法

说明书

本发明提供了一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记和选育方法，涉及分子标记辅助育种技术领域。本发明利用奶牛SNP芯片获得覆盖奶牛全基因组的SNP标记，与奶牛的乳蛋白率进行关联分析，经过多重校正筛选出与乳蛋白率显著相关的SNP分子标记，既可直接应用于分子标记辅助育种，同时也可以通过定位确定该SNP分子标记上下游的基因进行后续研究。本发明通过检测SNP分子标记，能够早期、快速、低成本、有效地预测奶牛的乳蛋白率，在提高奶牛生产性能方面具有广阔的应用前景，并能够取得良好的经济效益。

技术领域

本发明属于分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记和选育方法。

背景技术

随着我国奶业的逐步发展，奶业的发展方向已逐步从单纯追求乳产量到追求乳品质转变。乳蛋白率是奶牛的重要经济性状，是评价乳品质的重要指标，是提高乳品质的关键。目前，我国有关奶牛的遗传育种研究主要基于北方的奶牛群体，而针对南方奶牛群体的育种研究的报道相对较少。与乳蛋白率的分子标记研究也多是基于北方的荷斯坦奶牛群体。由于南北气候等自然环境的差异，南方荷斯坦奶牛的基因表达和表型可能与北方奶牛存在一定的差异，所以前人基于北方荷斯坦奶牛的乳蛋白率相关的分子标记研究可能不适用于南方荷斯坦奶牛群体。因此，在南方荷斯坦奶牛群体中进行乳蛋白率相关的分子标记的研究，对南方荷斯坦奶牛群体的分子标记辅助选择及育种改良中具有重要意义。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记和选育方法，通过检测SNP分子标记，能够快速、低成本、有效地预测奶牛的乳蛋白率，在提高奶牛生产性能方面具有广阔的应用前景，可以提高南方荷斯坦奶牛群体的乳蛋白率水平。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的在Ensemble数据库中对应牛的rs109464209，所述SNP位点位于Chr.16:41118210；

所述SNP位点的多态性为C和T。

优选的，所述SNP分子标记位于SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第201位碱基。

优选的，所述SNP分子标记的优势基因型为C/C。

本发明还提供了一种分子标记辅助选育乳蛋白率率高的南方荷斯坦奶牛的方法，包括以下步骤：利用鉴定上述的SNP分子标记的多态性，保留C/C基因型的奶牛。

优选的，所述鉴定的方法包括基因芯片法。

有益效果：本发明利用奶牛SNP芯片(GGP Bovine 100k)获得覆盖奶牛全基因组的SNP标记，与奶牛的乳蛋白率进行关联分析，经过多重校正筛选出与乳蛋白率显著相关的SNP分子标记，既可直接应用于分子标记辅助育种，同时也可以通过定位确定该SNP分子标记上下游的基因进行后续研究。在本发明中，该SNP频率在乳蛋白率较高的奶牛和乳蛋白率较低的奶牛中存在显著差异，基因型为C/C的奶牛平均乳蛋白率最高，基因型为T/C的奶牛平均乳蛋白率次之，基因型为T/T的奶牛平均乳蛋白率最低，因此可以通过早期检测的方法，检测候选群体奶牛该SNP分子标记的基因型，对具有优势基因型的个体进行选择，可以提高群体的乳蛋白率水平。本发明通过检测SNP分子标记，能够早期、快速、低成本、有效地预测奶牛的乳蛋白率，在提高奶牛生产性能方面具有广阔的应用前景，并能够取得良好的经济效益。

附图说明

图1为南方荷斯坦奶牛乳蛋白率的全基因组关联分析结果曼哈顿图。

具体实施方式

本发明提供了一个与南方荷斯坦奶牛乳蛋白率相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的在Ensemble数据库中对应牛的rs109464209，所述SNP位点位于Chr.16:41118210；