[发明专利]一种基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡在审
申请号: | 202111549292.0 | 申请日: | 2021-12-17 |
公开(公告)号: | CN114181907A | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 李天文;朱剑虹 | 申请(专利权)人: | 李天文;朱剑虹 |
主分类号: | C12N5/10 | 分类号: | C12N5/10;C12N15/113;C12N15/55;C12N15/85 |
代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 | 代理人: | 张晓敏;费开逵 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr casrx rna 编辑 系统 靶向 炎症 因子 细胞 微囊泡 | ||
1.一种基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡,其由转染了目的质粒的工程细胞所表达而获得,所述细胞微囊泡内包含由外泌信号肽引导的CRISPR/CasRx编辑酶和靶向炎症因子的sgRNA。
2.根据权利要求1所述基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡,其特征在于,所述目的质粒中包括CRIPPR/CasRx序列及其启动子、外泌信号肽、Tag序列、终止信号序列、靶向炎症因子的sgRNA序列及其启动子。
3.根据权利要求1所述基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡,其特征在于,其特征在于,所述目的质粒中CRISPR/CasRx序列的启动子为CAG启动子;所述外泌信号肽选自tPA、Human IgG2、Human Insulin、ARRDC1、ARRDC1+2xWW domain、HumanOSM、Mouse Ig Kappa或BM40;所述Tag序列为HA-tag序列;所述终止信号为polyA终止信号序列;所述sgRNA序列的启动子为U6启动子序列;所述炎症因子为IL-6、TNFa、IL-18、IL-1b和IFNr。
4.根据权利要求3所述基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡,其特征在于,所述sgRNA序列的具体核苷酸序列如下:
IL-6sgRNA:acaggtctgttgggagtggtatcctctgtg;
TNFa sgRNA:tttgctacgacgtgggctacaggcttgtc;
IL-18sgRNA:ttcacagagagggtcacagccagtcctctt;
IL-1b sgRNA:aacgtcacacaccagcaggttatcatcatc;
IFNr sgRNA:actgtgccgtggcagtaacagccagaaac。
5.根据权利要求1所述基于CRISPR/CasRx RNA编辑系统靶向炎症因子的细胞微囊泡,其特征在于,所述工程细胞由普通细胞系或干细胞转染目的质粒得到。
6.一种用于制备工程细胞的目的质粒,其包括CRIPPR/CasRx序列及其启动子、外泌信号肽、Tag序列、终止信号序列、靶向炎症因子的sgRNA序列及其启动子。
7.根据权利要求6所述用于制备工程细胞的目的质粒,其特征在于,所述炎症因子为IL-6、TNFa、IL-18、IL-1b和IFNr;所述sgRNA序列的具体核苷酸序列如下:
IL-6sgRNA:acaggtctgttgggagtggtatcctctgtg;
TNFa sgRNA:tttgctacgacgtgggctacaggcttgtc;
IL-18sgRNA:ttcacagagagggtcacagccagtcctctt;
IL-1b sgRNA:aacgtcacacaccagcaggttatcatcatc;
IFNr sgRNA:actgtgccgtggcagtaacagccagaaac。
8.一种靶向炎症因子的sgRNA序列的筛选方法,包括以下步骤:
1)将目的炎症因子的cDNA序列从小鼠或人的cDNA文库中拷贝下来,连接进VS005载体或DP375载体质粒,炎症因子片段后面依次接2A序列和报告基因,获得的质粒命名为1号质粒;
2)构建携带CRISPR/CasRx序列、待筛选的sgRNA序列以及与1号质粒中报告基因不同波段的荧光报告基因的质粒,命名为2号质粒;
3)将所述1号质粒和2号质粒共同转染至自身不表达所述目的炎症因子的哺乳动物细胞,转染后使该哺乳动物细胞先过表达1号质粒上相应的炎症因子,之后被2号质粒上的CRISPR/CasRx和待筛选的sgRNA敲低,最终通过1号质粒的荧光强度判断相应sgRNA的效率,筛选出合适的sgRNA序列。
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