[发明专利]一种ACOT7-NPHP4融合基因及其应用和检测试剂盒

说明书

本发明提供一种ACOT7‑NPHP4融合基因及其应用和检测试剂盒，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。本发明首先发现、鉴定了急性淋巴细胞白血病中存在新融合基因ACOT7‑NPHP4，评估认为ACOT7‑NPHP4可以作为急性淋巴细胞白血病的特异性分子标志物，进而开发了一款临床上可用于诊断、检测患者微小残留病(MRD)的试剂盒。试剂盒利用Taqman探针实时荧光PCR对急性淋巴细胞白血病患者体内ACOT7‑NPHP4融合基因进行绝对定量，其检测特异性好、灵敏度高、方法简便高效、成本低廉，能够满足临床上的诊疗需求。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒。

背景技术

急性淋巴细胞白血病(ALL)是临床常见的血液恶性肿瘤，大多数ALL患者通过临床多药化疗诱导获得缓解，但半数还是会复发。而通过监测微小残留病灶(MRD)，即治疗后持续存在的白血病原始细胞数低于常规形态学检测的限度，越来越多地用于评估治疗效果，是联合化疗后最有效的评判标准，对改善患者预后至关重要。并且多项研究表明，MRD是儿童和成人ALL的独立预后因素。因此，几乎所有儿童ALL和大部分成人ALL的治疗方案均与监测MRD结合来评估治疗后的反应。

现如今，监测MRD的方法是利用白血病细胞特有的特征来将它们与正常细胞区分开来，筛选出肿瘤细胞的分子标志物，包括融合基因(例如通过聚合酶链反应(PCR)方法检测BCR/ABL1是筛选费城染色体阳性B-ALL(ph⁺-ALL)患者的首选方法)、T细胞受体(TCR)基因重排和异常白血病相关免疫表型(LAIP)等。但如今仍然有很大比例的ALL患者缺乏分子标志来监测MRD，从而为评估治疗疗效，预防复发和治疗预后带来较大困难。因此发现并监测与ALL相关的新融合基因对于病情诊断、治疗方案制定、疗效评价、预后评估及病变复发具有重要的临床意义。

ACOT7又称Acyl-CoA Thioesterase 7，编码酰基辅酶A硫酯酶，可将酰基辅酶A水解为游离脂肪酸和辅酶A(CoASH)，具有调节细胞内酰基辅酶A、游离脂肪酸和CoASH水平的能力，可能在大脑中发挥重要的生理功能。有文章已经表明ACOT7表达水平高的急性髓性白血病(AML)患者通常预后较差，即使已经接受了异基因干细胞移植治疗。而NPHP4即Nephrocystin4，其编码的蛋白质参与肾小管发育，其突变与肾病有关。上述两个基因在该ALL患者里形成了一种新融合基因ACOT7-NPHP4，并且是至今未见文献报道的分子标志物。

发明内容

本发明的第一个目的在于，提供一种急性淋巴细胞白血病融合基因ACOT7-NPHP4。

本发明的第二个目的在于，提供融合基因ACOT7-NPHP4在制备急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测制剂或试剂盒中的应用。

本发明的第三个目的在于，提供一种急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测试剂盒。

本发明第四个目的在于，提供一种非疾病诊断目的的检测ACOT7-NPHP4融合基因的方法。

为了实现上述第一个目的，本发明提供了一种ACOT7-NPHP4融合基因，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。

为了实现上述第二个目的，本发明提供了ACOT7-NPHP4融合基因在制备急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测制剂或试剂盒中的应用。部分急性淋巴细胞白血病患者携带融合基因ACOT7-NPHP4，其可以作为患者特异性的分子标志物，并应用于临床诊断、定期监测患者的微小残留病变。

为了实现上述第三个目的，本发明提供了一种急性淋巴细胞白血病诊断和/或监测试剂盒，所述试剂盒含有检测ACOT7-NPHP4融合基因或检测其表达产物的试剂

作为一个优选方案，所述试剂盒包括上游引物、下游引物、Taqman探针、内参、PCR反应缓冲液、阳性对照和阴性对照；