[发明专利]银屑病关节炎的诊断标记物及其用途在审
申请号: | 202111531364.9 | 申请日: | 2021-12-14 |
公开(公告)号: | CN114015769A | 公开(公告)日: | 2022-02-08 |
发明(设计)人: | 牛振民;颜克香;张正华;黄薇 | 申请(专利权)人: | 上海市生物医药技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/686;G16B25/20 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陶启长;韦东 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 银屑病 关节炎 诊断 标记 及其 用途 | ||
本发明提供与银屑病关节炎相关的miRNA标记物,检测所述miRNA标记物的试剂及其用途。
技术领域
本发明属于分子辅助诊断领域,具体涉及在银屑病关节炎诊断中的应用。
背景技术
银屑病关节炎(Psoriatic arthritis,PsA)影响多达30%的银屑病患者,导致了病人的生活质量下降。PsA涉及多种部位,包括外周和中轴型关节炎、附着点炎、指端炎和指甲疾病。银屑病关节炎的早期干预对预防功能丧失和永久性残疾很重要。然而,皮肤症状通常先于关节炎,使得PsA的确诊平均时间延迟了5年。因此,用于检测预警银屑病关节炎患者,将其从寻常型银屑病(PsO)中区分出来的生物标志物对皮肤科医生来说非常重要。
近年来,人们对细胞外囊泡(extracellular vesicle,EV),比如外泌体所携带的循环微小核糖核酸(miRNA)的重要性越来越感兴趣。循环中的miRNA在细胞间的远近通讯中起着重要作用,并能调节基因表达。外泌体循环miRNA丰富、稳定且高度保守。它们是几种人类疾病的新型诊断和预后生物标志物,如过敏性疾病、心血管疾病、和癌症。由于miRNAs的分布因种族而异,不同人种之间与疾病相关的miRNA仍需要进一步研究。
发明内容
本发明的目的是提供检测miRNA的试剂及其在银屑病关节炎诊断中的用途。通过与寻常型银屑病病人相比较的方法,将银屑病关节炎病人从全体银屑病病人中识别出来进行预警,为早期干预提供条件。
本发明第一方面提供一种分离的来自哺乳动物的RNA,包含miR-191-3p或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体。
在一个或多个实施方案中,所述RNA包含SEQ ID NO:1所示序列或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体。
本发明第二方面提供检测RNA的引物或探针,所述RNA包含miR-191-3p或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体,所述引物与所述RNA杂交并且能扩增出所述RNA或其功能片段或它们的对应DNA,所述探针与所述RNA或其功能片段或它们的对应DNA杂交。
在一个或多个实施方案中,所述RNA包含SEQ ID NO:1所示序列或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体。
在一个或多个实施方案中,所述引物包含SEQ ID NO:3所述的特异扩增引物或与其具有至少90%序列相同性的变体。进一步地,所述引物任选还包含反转录引物和/或通用扩增引物。反转录引物具有SEQ ID NO:2所述的序列或与其具有至少90%序列相同性的变体。通用扩增引物具有SEQ ID NO:4所述的序列或与其具有至少90%序列相同性的变体。
本发明第三方面提供记载有RNA的序列的介质,所述RNA包含miR-191-3p或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体。所述介质用于与RNA测序数据比对以确定所述RNA的存在或含量。
在一个或多个实施方案中,所述RNA包含SEQ ID NO:1所示序列或其功能片段或其pri-miRNA或pre-miRNA,或与它们具有至少70%相同性的变体。
在一个或多个实施方案中,所述介质是印有所述序列的卡片,例如纸质、塑料、金属、玻璃卡片。
在一个或多个实施方案中,所述介质是存储有所述序列和计算机程序的计算机可读介质,当所述计算机程序被处理器执行时,实现下述步骤:将样品的RNA测序数据与所述序列比较,从而获得所述样品中含所述序列的RNA的存在和水平。
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