[发明专利]一种用于检测核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B的试剂盒及其应用有效
| 申请号: | 202111480097.7 | 申请日: | 2021-12-07 |
| 公开(公告)号: | CN113881752B | 公开(公告)日: | 2022-03-11 |
| 发明(设计)人: | 张艺瀚;卢宇靖;郭晓纯;钟家本;方志远 | 申请(专利权)人: | 广东工业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/34 | 分类号: | C12Q1/34;G01N21/64 |
| 代理公司: | 广东广信君达律师事务所 44329 | 代理人: | 戴绪霖 |
| 地址: | 510062 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 检测 核酸 胞嘧啶 脱氨酶 apobec3b 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种用于检测核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括单链DNA,所述单链DNA的互补链、限制性核酸内切酶BspH Ⅰ,以及缓冲液;
所述单链DNA的序列如SEQ ID NO:1所示;所述单链DNA的5’端被荧光基团修饰,3’端被淬灭基团修饰。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,其特征在于,所述荧光基团包括FAM、TET、JOE、HEX、CY3、TAMRA、ROX、Texas Red、LC RED640、CY5和LC RED705中的至少一种,所述淬灭基团包括BHQ1、BHQ2、BHQ3和DABCYL中的至少一种。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述缓冲液为第一缓冲液、第二缓冲液、第三缓冲液或第四缓冲液;
所述第一缓冲液包括10–50 mM CH3COOK, 10-100 mM Tris-acetate,10-100 mM(CH3COO)2Mg,0.1-10 μg/mL BSA, pH 5-8;
所述第二缓冲液包括50-150 mM NaCl, 10-50 mM KCl,5-20 mM Na2HPO4,1-10 mMKH2PO4, pH 5-8;
所述第三缓冲液包括5-100 mM HEPES, 50-200mM NaCl,pH 5-8;
所述第四缓冲液包括5-50 mM Tris-HCl, 0.5-5 mM EDTA, pH 5-8。
4.一种用于筛选核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B抑制剂的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1-3任一所述的试剂盒,以及核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B。
5.一种用于筛选核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B抑制剂的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
S1,将待测化合物与核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B在缓冲液中反应;
S2,加入单链DNA,充分混匀后反应;
S3,加入所述单链DNA的互补链和限制性核酸内切酶BspH Ⅰ,充分混匀后反应;
S4,对步骤S3中反应后的产物进行荧光检测;
所述单链DNA的序列如SEQ ID NO:1所示;所述单链DNA的5’端被荧光基团修饰,3’端被淬灭基团修饰。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述荧光基团包括FAM、TET、JOE、HEX、CY3、TAMRA、ROX、Texas Red、LC RED640、CY5和LC RED705中的至少一种,所述淬灭基团包括BHQ1、BHQ2、BHQ3和DABCYL中的至少一种。
7.如权利要求1-3任一所述的试剂盒在制备用于检测核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B的试剂盒或者用于筛选核酸胞嘧啶脱氨酶APOBEC3B抑制剂中的应用。
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