[发明专利]一种用于癫痫患者无创诊断的肠道微生物基因标志物及其应用

权利要求书

1.一种用于区别癫痫患者和健康人群的肠道微生物基因标志物，其特征在于：由SEQID NO:1-22所示的22种微生物基因组成。

2.一种肠道微生物模型的检测试剂，包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-22所示的22种微生物基因的引物。

3.根据权利要求2所述的检测试剂，其特征在于：所述引物序列为SEQ ID NO:23-24。

4.根据权利要求2或3所述的检测试剂，其特征在于：所述肠道微生物模型适用于区分癫痫患者与健康人群。

5.权利要求2或3所述的检测试剂在制备癫痫与健康人群的区分检测试剂盒中的应用，所述检测试剂用于检测权利要求1所述的肠道微生物基因。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于：对所述对象的粪便进行检测，以便确定该样本是否包含所述的微生物基因。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于：通过收集入组对象的粪便样本，抽提微生物总DNA，完成微生物DNA的16S rDNA Miseq测序，检测是否存在权利要求1所述的22种微生物基因。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于：通过收集入组对象的粪便样本，抽提微生物总DNA，进行肠道菌群的16S rDNA Miseq测序；基于高通量测序数据，在训练集中建立癫痫患者与健康人群的微生物区别模型，建立癫痫患病率指数；POD指数在验证集中计算其区别能力，进行验证。

9.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，具体包括：

(1)收集入组对象的粪便样本，入组对象包括24例癫痫患者和50例健康对照，按照DNA的标准抽提方法完成粪便样本中微生物总DNA的抽提，在Illumina MiSeq平台完成肠道菌群的16S rDNA高通量测序工作；

(2)基于高通量测序数据，在微生物区别模型的训练集中，在13例癫痫患者和37例健康对照者之间，基于一个随机森林模型，通过一个五倍交叉验证的算法，鉴定了用于该模型的最佳的22个微生物基因标志物；

(3)基于22个微生物基因标志物，通过使用随机生成的决策树的比率来计算癫痫的患病率指数；

(4)该微生物区别模型在13例癫痫患者和37例健康对照者之间的区别能力达到97.71％，POD指数在癫痫患者中明显升高，两组之间有显著性差异；

(5)在验证集中，该微生物区别模型在11例癫痫患者和13例健康对照之间的区别能力达到99.3％；POD指数在癫痫患者中明显升高，两组之间有显著性差异。

10.一种用于区别癫痫患者和健康对照者的肠道微生物模型的试剂盒，包括权利要求2或3所述的检测试剂。