[发明专利]一种福式志贺氏菌特异基因的引物组及其应用

说明书

本发明提供了一种福式志贺氏菌特异基因的引物组及其应用。本发明的福式志贺氏菌特异基因的引物组包括SEQ ID NO：1所示的外引物F3和SEQ ID NO：2所示的外引物B3，此外还可以包括SEQ ID NO：3所示的内引物FIP和SEQ ID NO：4所示的内引物BIP。本发明的福式志贺氏菌检测方法采用上述福式志贺氏菌特异基因的引物组进行PCR检测或LAMP检测。本发明的福式志贺氏菌特异基因的引物组能够简便、可视化、快速、准确地对福式志贺氏菌进行检测，具有灵敏度高、特异性好等优势。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其是涉及一种福式志贺氏菌特异基因的引物组及其应用。

背景技术

痢疾或细菌性痢疾是通过粪-口途径感染的急性感染性腹泻，以其高发病率(36.4/1000)和高死亡率(2.9/10万)威胁着全球的公共卫生系统。据估计，由志贺菌属细菌引起的志贺氏细菌性痢疾每年在全球引起1.65亿人感染，五岁以下的幼儿占比较高。志贺菌属细菌根据抗原结构的不同分为痢疾志贺氏菌、福式志贺氏菌、鲍氏志贺氏菌和宋内志贺氏菌4种，分别对应于A、B、C和D亚群。研究发现，福式志贺氏菌感染的死亡率显著高于其它三种，约60％的细菌性痢疾是由福式志贺氏菌引起的。

目前，病原菌的检测主要依靠常规的细菌学培养方法、免疫学方法、核酸探针技术、PCR等。细菌学培养方法需经富集培养、选择性分离、形态特征观察、生理生化反应、血清学鉴定等过程，一般需4-7天，操作繁琐、费时耗力，并且存在敏感性低、特异性差、无法检测受损菌及死菌等缺陷；免疫学方法易污染，交叉反应比较严重，存在假阳性多、灵敏度偏低等问题；核酸探针检测技术最大的优点是特异性强，但也存在灵敏度不够高、检测一种菌就需制备一种探针等缺陷。常规PCR方法检测的灵敏度和特异性都能有所保障，但其检测时间长，需要昂贵的PCR控温仪器等配套仪器，不能很好地用于床旁检测(POCT)。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种福式志贺氏菌特异基因的引物组及其应用，该福式志贺氏菌特异基因的引物组能够简便、可视化、快速、准确地对福式志贺氏菌进行检测，具有灵敏度高、特异性好等优势。

本发明提供一种福式志贺氏菌特异基因的引物组，包括SEQ ID NO：1 所示的外引物F3和SEQ ID NO：2所示的外引物B3，具体如下：

外引物F3：TGTTGGCGCATCTGATGG(SEQ ID NO：1)；

外引物B3：GCCAATCTCTTCGGAGGC(SEQ ID NO：2)。

进一步地，本发明的福式志贺氏菌特异基因的引物组还包括SEQ ID NO：3所示的内引物FIP和SEQ ID NO：4所示的内引物BIP，具体如下：

内引物FIP：

CGCTGAAGTACTGCTCTCCGCTTTTAGAGCCACGACTATGCTGT (SEQ ID NO：3)；

内引物BIP：

CTGGTGACAATAACCCGGACCATTTTAGGAGGATCCTGCTCAAGC (SEQ ID NO：4)。

本发明还提供上述福式志贺氏菌特异基因的引物组在福式志贺氏菌检测中的应用。

本发明还提供一种福式志贺氏菌检测试剂盒，包括上述福式志贺氏菌特异基因的引物组。

在一实施方式中，福式志贺氏菌检测试剂盒包括：外引物F3、外引物 B3、2×PCRMix和去核酸酶水。

在另一实施方式中，福式志贺氏菌检测试剂盒包括：外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP、LAMP 2×Master Mix和去核酸酶水。