[发明专利]一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法、系统及平台在审

专利信息
申请号: 202111385652.8 申请日: 2021-11-22
公开(公告)号: CN114613431A 公开(公告)日: 2022-06-10
发明(设计)人: 高翠;王伦基;陈汕;韩蓝青 申请(专利权)人: 赛业(广州)生物科技有限公司
主分类号: G16B20/50 分类号: G16B20/50;G16B40/00;G16B45/00
代理公司: 广州容大知识产权代理事务所(普通合伙) 44326 代理人: 刘新年
地址: 510000 广东省广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 碱基 突变 影响 mrna 剪接 预测 方法 系统 平台
【权利要求书】:

1.一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述方法具体包括如下步骤:

获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理;

构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据;

实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据。

2.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤之后,还包括如下步骤:

获取反馈数据信息,根据所述反馈数据信息实时对所述AI模型进行迭代训练。

3.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理步骤中,还包括如下步骤:

将所述碱基突变数据信息映射回至基因序列上,并对所述序列实时进行突变转换;

调整突变转换后序列相对应的注释信息,并实时构建突变前后的碱基对应关系。

4.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据步骤中,还包括如下步骤:

构建训练数据集,并实时生成序列长度;

对所述序列编码处理,并实时构建生成AI模型。

5.根据权利要求1或4所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据步骤中,还包括如下步骤:

将序列以生成序列长度每跨度1bp切割成短序列,并对所述短序列实时编码处理;

根据构建的AI模型,对编码处理后的短序列实时进行数据预测。

6.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤中,还包括如下步骤:

判定原切割位置是否改变了切割类型分类;

获取剪接供体位置及剪接受体位置,并生成预测值峰值位置。

7.根据权利要求1或6所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤中,还包括如下步骤:

判定剪接供体或受体附近突变发生类型,生成最终的剪接方式数据信息,并对所述最终剪接方式数据信息进行解析处理。

8.一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测系统,其特征在于所述的系统具体包括:

获取单元,用于获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理;

构建生成单元,用于构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据;

分析处理可视化单元,用于实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据。

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