[发明专利]一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法、系统及平台在审
| 申请号: | 202111385652.8 | 申请日: | 2021-11-22 |
| 公开(公告)号: | CN114613431A | 公开(公告)日: | 2022-06-10 |
| 发明(设计)人: | 高翠;王伦基;陈汕;韩蓝青 | 申请(专利权)人: | 赛业(广州)生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B40/00;G16B45/00 |
| 代理公司: | 广州容大知识产权代理事务所(普通合伙) 44326 | 代理人: | 刘新年 |
| 地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 碱基 突变 影响 mrna 剪接 预测 方法 系统 平台 | ||
1.一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述方法具体包括如下步骤:
获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理;
构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据;
实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据。
2.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤之后,还包括如下步骤:
获取反馈数据信息,根据所述反馈数据信息实时对所述AI模型进行迭代训练。
3.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理步骤中,还包括如下步骤:
将所述碱基突变数据信息映射回至基因序列上,并对所述序列实时进行突变转换;
调整突变转换后序列相对应的注释信息,并实时构建突变前后的碱基对应关系。
4.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据步骤中,还包括如下步骤:
构建训练数据集,并实时生成序列长度;
对所述序列编码处理,并实时构建生成AI模型。
5.根据权利要求1或4所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据步骤中,还包括如下步骤:
将序列以生成序列长度每跨度1bp切割成短序列,并对所述短序列实时编码处理;
根据构建的AI模型,对编码处理后的短序列实时进行数据预测。
6.根据权利要求1所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤中,还包括如下步骤:
判定原切割位置是否改变了切割类型分类;
获取剪接供体位置及剪接受体位置,并生成预测值峰值位置。
7.根据权利要求1或6所述的一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测方法,其特征在于所述实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据步骤中,还包括如下步骤:
判定剪接供体或受体附近突变发生类型,生成最终的剪接方式数据信息,并对所述最终剪接方式数据信息进行解析处理。
8.一种基于碱基突变影响mRNA剪接的预测系统,其特征在于所述的系统具体包括:
获取单元,用于获取碱基突变数据信息,并对所述碱基突变数据信息实时转换处理;
构建生成单元,用于构建AI模型,通过所述AI模型对突变前后的序列进行剪切预测,并实时生成剪接模型预测数据;
分析处理可视化单元,用于实时对所述预测数据进行分析处理,并可视化展示分析处理最终数据。
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