[发明专利]一种鉴定葡萄无核性状的KASP标记与应用在审
申请号: | 202111341222.6 | 申请日: | 2021-11-12 |
公开(公告)号: | CN114134246A | 公开(公告)日: | 2022-03-04 |
发明(设计)人: | 徐炎;王富强;原筱简;刘国甜;许腾飞 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01G17/02;A01H1/00;A01H1/02 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 许富强 |
地址: | 712100 陕西省咸阳市*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 葡萄 无核 性状 kasp 标记 应用 | ||
本发明公开了一种鉴定葡萄无核性状的KASP标记与应用,该KASP分子标记的SNP位点位于葡萄基因组PN40024第18号染色体第26889437位碱基,具有A/C多态性。本发明的KASP分子标记引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示,采用该引物组通过KASP技术进行PCR反应和荧光检测,根据FAM、HEX两种不同荧光的峰值大小,绘制聚类图,判定待测样品的基因型;若待测样品的基因型为A:C,则该葡萄表现为无核性状,若该位点基因型为C:C,葡萄种子表现为有核,以此标记开展葡萄无核分子辅助育种,可以大大提高育种进程。
技术领域
本发明涉及一种鉴定葡萄无核性状的分子标记,具体涉及一种鉴定葡萄 无核性状的KASP标记与应用。
背景技术
无核葡萄由于常规育种周期长,且无法获得稳定遗传的种子,导致无核 葡萄的育种进度缓慢。通过无核葡萄分子标记,在苗期进行辅助选择,可有 效提高葡萄育种效率、降低育种成本,因此开发准确性高、通用性广的无核 分子标记对于无核葡萄育种具有重要的意义。
目前,研究人员针对葡萄无核性状开发了SCAR(Sequence CharacterizedAmplified Region,序列特征扩增区)、RAPD(Random amplified polymorphic DNA,随机扩增多态性DNA标记)、SSR(Simple Sequence Repeats,简单 重复序列)、SNP(SingleNucleotide Polymorphism,单核苷酸多态性)等多 种标记类型。现有技术具体如下:
(1)LAHOGUE等(1998)和MEJIA等(2003)通过BSA(Bulk Segregant Analysis,集群分离分析法)分别开发了与SDI(Seed Development Inhibitor, 种子发育抑制)位点连锁不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)的SCAR标 记SCC8-1080和SCF27-2000,MEJIA等(2003)还研究证明这两个标记更 适合应用于双亲均为无核的后代群体。
(2)王跃进等(2002)以‘无核白’为试材,开发出1个GSLP1-569 特异的RAPD标记,LI等(2015)和LI等(2018)的研究证明GSLP1-569 标记仅适合于对‘无核白’及其亲缘关系较近的无核品种的分子检测。
(3)PELLERONE等(2001)开发了SSR标记VMC7f2,CABEZAS 等(2006)和ROYO等(2018)利用不同的杂交群体进行QTL分析认为 VMC7f2分子标记的198bp等位点与无核性状显著关联,但VMC7f2标记在 不同遗传背景下有效性会明显不同(MEJIA et al.2011;AKKURT et al.2012)。
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