[发明专利]一种饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法有效

专利信息
申请号: 202111315456.3 申请日: 2021-11-08
公开(公告)号: CN114038496B 公开(公告)日: 2022-06-03
发明(设计)人: 蒋鹏 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B50/00;G16H70/40;G06Q10/06;G06Q50/02
代理公司: 北京正华智诚专利代理事务所(普通合伙) 11870 代理人: 杨浩林
地址: 610064 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 饮用 水源 水体 抗生素 抗性 基因 相对 风险 评价 方法
【权利要求书】:

1.一种饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、对饮用水源水体中的ARGs丰度和ARBs丰度进行预处理,得到ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集;

步骤S1包括以下分步骤:

S11、将饮用水源水体中的ARGs丰度转换为ARGs相对丰度;

S12、将饮用水源水体中的ARBs丰度转换为ARBs相对丰度;

S13、将ARGs相对丰度构建为具备K个元素的一组样本数据,即ARGs组样本数据集;

S14、将ARBs相对丰度构建为具备K个元素的一组样本数据,即ARBs组样本数据集;

S2、对ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集进行数据缩放处理,得到ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值;

步骤S2中对ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集进行数据缩放处理的公式为:

其中,为ARBs组样本数据集FARB中第m类ARBs相对丰度数据的丰度缩放值,为ARGs组样本数据集FARG中第n类ARGs相对丰度数据的丰度缩放值,max(FARB)为ARBs组样本数据集FARB中ARBs相对丰度数据的最大值,min(FARB)为ARBs组样本数据集FARB中ARBs相对丰度数据的最小值,max(FARG)为ARGs组样本数据集FARG中ARGs相对丰度数据的最大值,min(FARG)为ARGs组样本数据集FARG中ARGs相对丰度数据的最小值;

S3、根据ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值,计算抗生素抗性相对风险评分;

步骤S3包括以下分步骤:

S31、对ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值进行风险赋值,得到ARGs风险评分和ARBs风险评分;

S32、根据ARGs风险评分和ARBs风险评分,计算ARGs总风险评分和ARBs总风险评分;

S33、对ARGs总风险评分和ARBs总风险评分进行归一化处理;

S34、根据归一化后的ARGs总风险评分和ARBs总风险评分的相对权重,计算抗生素抗性相对风险评分。

2.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S31中对ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值进行风险赋值的公式为:

其中,为第m类ARBs丰度缩放值的风险评分,为第m类ARBs丰度缩放值的风险系数,为第n类ARGs丰度缩放值的风险评分,为第n类ARGs丰度缩放值的风险系数,为ARBs组样本数据集FARB中第m类ARBs相对丰度数据的丰度缩放值,为ARGs组样本数据集FARG中第n类ARGs相对丰度数据的丰度缩放值。

3.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S32中计算ARGs总风险评分和ARBs总风险评分的公式为:

其中,SARB为ARBs总风险评分,SARG为ARGs总风险评分,M为ARBs的类别数,N为ARGs的类别数,为第m类ARBs丰度缩放值的风险评分,为第n类ARGs丰度缩放值的风险评分。

4.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S34中计算抗生素抗性相对风险评分的公式为:

其中,为抗生素抗性相对风险评分,α为归一化后的ARBs总风险评分与归一化后的ARGs总风险评分的相对权重,为归一化的ARBs总风险评分,为归一化的ARGs总风险评分。

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