[发明专利]一种饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法有效
申请号: | 202111315456.3 | 申请日: | 2021-11-08 |
公开(公告)号: | CN114038496B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 蒋鹏 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B50/00;G16H70/40;G06Q10/06;G06Q50/02 |
代理公司: | 北京正华智诚专利代理事务所(普通合伙) 11870 | 代理人: | 杨浩林 |
地址: | 610064 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 饮用 水源 水体 抗生素 抗性 基因 相对 风险 评价 方法 | ||
1.一种饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、对饮用水源水体中的ARGs丰度和ARBs丰度进行预处理,得到ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集;
步骤S1包括以下分步骤:
S11、将饮用水源水体中的ARGs丰度转换为ARGs相对丰度;
S12、将饮用水源水体中的ARBs丰度转换为ARBs相对丰度;
S13、将ARGs相对丰度构建为具备K个元素的一组样本数据,即ARGs组样本数据集;
S14、将ARBs相对丰度构建为具备K个元素的一组样本数据,即ARBs组样本数据集;
S2、对ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集进行数据缩放处理,得到ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值;
步骤S2中对ARGs组样本数据集和ARBs组样本数据集进行数据缩放处理的公式为:
其中,为ARBs组样本数据集FARB中第m类ARBs相对丰度数据的丰度缩放值,为ARGs组样本数据集FARG中第n类ARGs相对丰度数据的丰度缩放值,max(FARB)为ARBs组样本数据集FARB中ARBs相对丰度数据的最大值,min(FARB)为ARBs组样本数据集FARB中ARBs相对丰度数据的最小值,max(FARG)为ARGs组样本数据集FARG中ARGs相对丰度数据的最大值,min(FARG)为ARGs组样本数据集FARG中ARGs相对丰度数据的最小值;
S3、根据ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值,计算抗生素抗性相对风险评分;
步骤S3包括以下分步骤:
S31、对ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值进行风险赋值,得到ARGs风险评分和ARBs风险评分;
S32、根据ARGs风险评分和ARBs风险评分,计算ARGs总风险评分和ARBs总风险评分;
S33、对ARGs总风险评分和ARBs总风险评分进行归一化处理;
S34、根据归一化后的ARGs总风险评分和ARBs总风险评分的相对权重,计算抗生素抗性相对风险评分。
2.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S31中对ARGs丰度缩放值和ARBs丰度缩放值进行风险赋值的公式为:
其中,为第m类ARBs丰度缩放值的风险评分,为第m类ARBs丰度缩放值的风险系数,为第n类ARGs丰度缩放值的风险评分,为第n类ARGs丰度缩放值的风险系数,为ARBs组样本数据集FARB中第m类ARBs相对丰度数据的丰度缩放值,为ARGs组样本数据集FARG中第n类ARGs相对丰度数据的丰度缩放值。
3.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S32中计算ARGs总风险评分和ARBs总风险评分的公式为:
其中,SARB为ARBs总风险评分,SARG为ARGs总风险评分,M为ARBs的类别数,N为ARGs的类别数,为第m类ARBs丰度缩放值的风险评分,为第n类ARGs丰度缩放值的风险评分。
4.根据权利要求1所述的饮用水源水体抗生素抗性基因相对风险评价方法,其特征在于,所述步骤S34中计算抗生素抗性相对风险评分的公式为:
其中,为抗生素抗性相对风险评分,α为归一化后的ARBs总风险评分与归一化后的ARGs总风险评分的相对权重,为归一化的ARBs总风险评分,为归一化的ARGs总风险评分。
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