[发明专利]一种预测鸡蛋壳颜色的方法及其专用的SNP位点

说明书

本发明公开了一种预测鸡蛋壳颜色的方法，包括如下步骤：检测待测鸡个体基于SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点和/或SNP4位点的基因型，如果待测鸡个体的基因组中基于SNP1位点的基因型为CC纯合型、基于SNP2位点的基因型为GG纯合型、基于SNP3位点的基因型为GG纯合型和/或基于SNP4位点的基因型为AA纯合型，则鸡蛋壳颜色为或疑似为白壳；SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点和SNP4位点依次位于鸡基因组第12号染色体的第3345012位、第3345976位、第3346276位和第3348704位。本发明提供的方法可以早期预测鸡个体、鸡品系或鸡品种的蛋壳颜色，具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种预测鸡蛋壳颜色的方法及其专用的SNP位点。

背景技术

家禽蛋壳颜色具有重要的经济价值，消费者对不同的蛋壳颜色具有一定的偏好性，因此有必要对蛋壳颜色性状进行研究和选育。鸡蛋壳颜色主要有褐壳、白壳和绿壳三种，主要蛋壳色素是原卟啉-IX和胆绿素，这两种色素的含量和比例不同会导致不同的蛋壳颜色。家禽蛋壳颜色长期受到关注，但它的形成机制还没有得到完整的解析。根据已有研究成果，褐壳蛋性状是受到多基因控制的数量性状，而白壳蛋性状是受到单基因或者少数基因控制的质量性状，绿壳蛋性状是由SLCO1B3基因控制的。从遗传角度来讲，褐壳蛋鸡携带褐壳基因产生褐壳鸡蛋，白壳蛋鸡在褐壳基因位点呈隐性或者在其他位点存在常染色体隐性基因抑制蛋壳色素的产生、转运或者沉积都会产生白壳鸡蛋。白壳蛋鸡主要以白来航鸡为主，而产白壳蛋的商品鸡是在白来航鸡的基础上培育的。

近年来，SNP作为第三代分子标记，以其数量多、分布广、遗传稳定等优点受到广泛重视。基于白壳蛋鸡、褐壳蛋鸡和绿壳蛋鸡的基因信息进行分析，可以挖掘更加稳定高效的SNP位点。因此，有必要探索基于SNP位点多态性进行鸡蛋壳颜色预测或辅助预测的方法。

发明内容

本发明的目的是预测或辅助预测鸡蛋壳颜色，从而进行鸡品种或品系的选育。

本发明首先保护用于检测鸡基因组中基于SNP1位点的基因型的物质甲、基于SNP2位点的基因型的物质乙、基于SNP3位点的基因型的物质丙和/或基于SNP4位点的基因型的物质丁在预测或辅助预测鸡蛋壳颜色中的应用。

本发明还保护用于检测鸡基因组中基于SNP1位点的基因型的物质甲、基于SNP2位点的基因型的物质乙、基于SNP3位点的基因型的物质丙和/或基于SNP4位点的基因型的物质丁在制备用于预测或辅助预测鸡蛋壳颜色的试剂盒中的应用。

用于检测鸡基因组中基于SNP1位点的基因型的物质甲、基于SNP2位点的基因型的物质乙、基于SNP3位点的基因型的物质丙和/或基于SNP4位点的基因型的物质丁在筛选或辅助筛选生产白壳蛋或褐壳蛋的鸡个体、鸡品系或鸡品种中的应用也属于本发明的保护范围。

用于检测鸡基因组中基于SNP1位点的基因型的物质甲、基于SNP2位点的基因型的物质乙、基于SNP3位点的基因型的物质丙和/或基于SNP4位点的基因型的物质丁在制备用于筛选或辅助筛选生产白壳蛋或褐壳蛋的鸡个体、鸡品系或鸡品种的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围。

用于检测鸡基因组中基于SNP1位点的基因型的物质甲、基于SNP2位点的基因型的物质乙、基于SNP3位点的基因型的物质丙和/或基于SNP4位点的基因型的物质丁在鸡遗传育种中的应用也属于本发明的保护范围。

上述任一所述的应用中，所述物质甲、所述物质乙、所述物质丙或所述物质丁可为引物。

上述任一所述的应用中，所述物质甲、所述物质乙、所述物质丙或所述物质丁可为进行鸡基因组测序所需的物质。

本发明还保护鸡基因组中SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点和/或SNP4位点的基因型的应用，可为A1)-A3)中的至少一种：

A1)预测或辅助预测鸡蛋壳颜色；