[发明专利]一种与鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用，属于分子育种技术领域，所述分子标记位于鸡MDFIC基因中的NC_006088.5：25921285位点的碱基处，碱基突变为T或C；该分子标记是以位于鸡MDFIC基因中的NC_006088.5：25921285位点为检测位点，分析该位点多态性与鸡腹脂性状的相关性，通过实验发现，该位点的等位基因TT有利于降低鸡腹脂的沉积。这为通过鸡腹脂性状进行鸡种选育及分子标记辅助选择提供了理论基础和参考数据。利用本发明分子标记构建的检测方法，相对于传统的通过表型数据选育，不仅成本低、操作简便，而且结果准确，并且该方法简单易行，可重复性强，在普通实验室即可进行。

技术领域

本发明涉及分子育种技术领域，特别是涉及一种与鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

鸡肉在我国的消费量仅次于猪肉，而肉鸡产业中黄羽肉鸡的种源为国内完全自主培育，自20世纪末期才开始有系统的黄羽肉鸡遗传育种工作。黄羽肉鸡因其肉质更佳，而广受人民群众的喜爱。但相比于白羽肉鸡，黄羽肉鸡的生长速度缓慢、饲料转化率低，因此，对于黄羽肉鸡的育种工作主要集中在提高饲料转化率和生长速度方面。随着育种工作的推进、营养的改善以及环境管理的科学性提升，黄羽肉鸡的生长性能得到了极大的提高。然而，在对生长速度的过度选育也会导致一些问题，尤其是肉鸡体内的腹部脂肪沉积不断的增多。腹部脂肪是鸡的一个重要胴体特征，适当的脂肪沉积可以改善肉质，过多的脂肪沉积则会大大降低肉鸡的饲料转化率，加大了养殖成本，更会影响肉鸡的抗病性能。如何降低黄羽肉鸡的腹部脂肪沉积已逐渐成为肉鸡产业中一个新的育种目标。

MyoD家族抑制剂结构域基因(MyoD family inhibitor domain containing，MDFIC)位于鸡的1号染色体(参考基因组GRCg6a，chrome 1)。MDFIC基因的产物被认为是一种包含MyoD抑制剂结构域的蛋白，其特征是具有特定的富含半胱氨酸的c端结构域，参与病毒基因组表达的转录调控，同时能够通过抑制MyoD的功能进而影响机体发育过程。据报道MDFIC基因可以调控淋巴瘤细胞的增殖与迁移进而影响鸡马立克氏病的发展。之前也有研究显示，MDFIC基因也可以控制鸡细胞的增殖、分化与凋亡。该基因在鸟类中的具体作用少有报道，尤其是在鸡上的研究更少。

单核苷酸多态性((Single nucleotide polymorphism，SNP)分子标记具有可遗传特性，可广泛用于黄羽肉鸡的大群体规模化育种筛选。随着人们对肉类食品需求的不断提高，亟需以新的育种方式来降低黄羽肉鸡腹部脂肪沉积。

发明内容

本发明的目的是提供一种与鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，该分子标记可以实现鸡腹脂性状的早期选择，节省生产成本并加快遗传育种进展，为分子标记育种选育工作提供基础。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与鸡腹脂性状相关的分子标记，所述分子标记位于鸡MDFIC基因中的NC_006088.5：25921285位点的碱基处，碱基突变为T或C。

本发明还提供一种上述的与鸡腹脂性状相关的分子标记的检测试剂在检测鸡腹脂性状中的应用。

本发明还提供一种检测上述的与鸡腹脂性状相关的分子标记的引物，包括：

上游引物F：TCCTTCTTCCCATCGCTTGC；

下游引物R：CTCTTGTGGAGCCTGCCATT。

本发明还提供一种上述的引物在检测鸡的腹脂性状或制备检测鸡的腹脂性状的试剂盒中的应用。

本发明还提供一种用于检测鸡腹脂性状的试剂盒，包括上述的引物。

本发明还提供一种检测鸡腹脂性状的方法，检测待测样本鸡中如上述的分子标记的基因型。