[发明专利]一种用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记的特异性引物及应用，其上游引物序列如SEQ No.1所示，下游引物序列如SEQ No.2所示。本发明所提供的SNP分子标记，可用于羔羊早期预测判断母绵羊初产时产羔数情况。针对刚出生的小母羊收集血液样本后，经基因分型后即可预测其性成熟配种后的产羔数高低；针对刚出生的小公羊收集血液样本后，经基因分型后即可知道其是否携带高产羔数性状的遗传特性，以指导其配种并预测其后代母羊的初产产羔数数情况。

技术领域

本发明涉及一种用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记及其应用，属于绵羊SNP分子标记技术领域。

背景技术

产羔数性状对于肉绵羊的生产经济效益贡献巨大。由于遗传等因素的影响，不同绵羊个体之间的每胎产羔数存在差异。尤其在初产水平上，一些绵羊之间往往表现出较大的产羔数差异，而在二胎以后产羔数水平上差异逐渐缩小。

实际生产中，绵羊的产羔数随着胎次增加，其每胎产羔数逐渐增加；即初产母羊的产羔数往往是其一生中产羔数量最少的一次。上述产羔现象主要是由于青年母羊子宫容受性、机体激素分泌水平和卵巢排卵机能等的局限性造成的。

目前，关于调控绵羊产羔数性状的功能基因研究，主要集中于FecB（BMPR1B）、BMP15、GDF9等基因中。其中，以FecB基因突变对绵羊的产羔数影响最为可靠，且相关研究更为透彻。FecB突变是指BMPR1B基因编码区发生了A746G的突变，从而导致蛋白质序列中的第249位的谷氨酰胺被置换为精氨酸（Q249R）；FecB突变后是通过提高绵羊的排卵数而增加其产羔数性状的。但是，上述基因对应的一些突变对绵羊的每一胎产羔数变化均有影响。本发明提供了一种与绵羊初产产羔数性状相关的分子标记及其应用，以此分子标记可进一步提高绵羊初产产羔水平。

目前，尚没有发现与绵羊初产产羔数性状紧密相关的SNP位点。

发明内容

本发明公开了一种用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记及其应用，通过本发明公开的特异性引物，所检测的SNP位点突变信息可以用于预测绵羊第一胎的产羔数性状及高繁殖力绵羊分子标记辅助育种工作。

为实现预测初产母绵羊产羔数性状的分子鉴定和未来的分子标记辅助选择高繁殖力绵羊品种，本发明采用如下技术方案。

一种用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记的特异性引物，其特征在于，上游引物序列如SEQ No.1所示，下游引物序列如SEQ No.2所示；

SEQ No.1：ACCCAAACAGAGGCAACACAG

SEQ No.2：TTTAGCACCACCAGAGTTTGAGG。

本发明所述用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记的特异性引物，其位于第11号染色体第36897532处；其SNP分子标记的多态性为T/C；所述SNP位点信息基于的绵羊基因组序列信息版本号为Oar_v4 .0，2015年11月。

本发明进一步公开了用于预测初产母绵羊产羔数的SNP分子标记的特异性引物在用于预测绵羊第一胎的产羔数性状，提高羊群产羔数方面的应用。特别是在选育高繁殖力绵羊中的应用。实验结果显示，位于第11号染色体第36897532处的SNP基因型为CC和TC型绵羊初产产羔数显著高于TT型（P0.05）。

本发明所述的用于预测初产母绵羊产羔数SNP分子标记的特异性引物进行预测方法，其特征在于按如下的步骤进行：

（1）颈静脉抽取（从其颈静脉抗凝血中提取）目标绵羊的抗凝血，并用于DNA提取；

（2）以提取的DNA为模板，利用SNP分子标记的特异性引物进行PCR扩增，退火温度为61℃，并获得目标PCR产物；

（3）对步骤（2）中的PCR产物进行sanger测序，分析其基因型（TT、TC、CC）；