[发明专利]检测RIG-I-Short的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用

说明书

本发明提供了检测RIG‑I‑Short的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用，属于生物技术领域。本发明中，所述RIG‑I‑Short的蛋白质序列如SEQ ID No.1所示。RIG‑I‑Short是RIG‑I的一种可变剪切体，通过抑制转录因子STAT1的核转位下调MHC I类分子的表达。本发明发现在结直肠患者的肿瘤组织中RIG‑I‑Short高表达。本发明发现过表达RIG‑I‑Short的肿瘤细胞能够逃逸宿主免疫系统的攻击，从而促进肿瘤生长。本发明发现过表达RIG‑I‑Short的肿瘤细胞对肿瘤疫苗等免疫疗法敏感性下降。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及检测RIG-I-Short的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用。

背景技术

RIG-I(retinoic acid-inducible gene-I)是定位在细胞浆中的双链RNA感受器。RIG-I蛋白由925个氨基酸组成，分子量大约为106kDa，包括N端两个CARD结构，中间的两个RNAHelicase结构域以及位于C端的CTD结构域。在静息状态下，RIG-I N端的CARD结构域被折叠在内部，不能发挥功能，在病毒感染过程中，RIG-I与病毒双链RNA结合，并暴露出CARD结构域。暴露出N端的RIG-I能够发生K63类型泛素化，并与定位于线粒体的MAVS等发生相互作用，进而激活转录因子IRF3，促进一型干扰素和其他促炎因子的转录，从而起到抗病毒的作用。除了在抗病毒免疫中发挥重要作用外，在肝癌中，RIG-I也表现出抑制肿瘤生长的功能。

肿瘤细胞对免疫治疗敏感性不高是目前肿瘤免疫治疗亟待解决的难题。在临床上，对PD-1/PD-L1单克隆抗体敏感的患者仅占15％～20％。作为T细胞活化的第一信号，T细胞受体-主要组织相容复合物(TCR-MHC)对于T细胞增殖并发挥功能起着不可或缺的作用。肿瘤细胞免疫原性的降低会导致其逃逸宿主免疫系统的攻击，从而促进了肿瘤的生长。目前，缺少一种能够诊断和预后肿瘤细胞对免疫治疗敏感性的生物标志物。

发明内容

本发明提供了检测RIG-I-Short的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用，RIG-I-Short能够作为诊断和预后肿瘤细胞对免疫治疗敏感性的生物标志物。

本发明提供了检测RIG-I-Short的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用；所述RIG-I-Short的蛋白质序列如SEQ ID No.1所示。

优选的，所述肿瘤诊断和/或预后的情况通过测定样本中RIG-I-Short的表达水平与相对应的癌旁组织中的表达水平相比上调而确定。

优选的，所述RIG-I-Short的表达水平的检测方法包括测序技术、核酸杂交技术或核酸扩增技术。

本发明还提供了检测RIG-I-Short的编码基因的表达水平的试剂在制备肿瘤诊断和/或预后的产品中的应用；所述编码基因包括编码所述RIG-I-Short的mRNA；编码所述RIG-I-Short的mRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。

优选的，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒。

优选的，所述肿瘤诊断和/或预后包括肿瘤对免疫治疗敏感性的诊断和/或预后。

优选的，所述检测RIG-I-Short的编码基因的表达水平的试剂包括上游引物和下游引物；所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。

本发明还提供了RIG-I-Short在构建预测肿瘤的计算模型中的应用；所述RIG-I-Short的蛋白质序列如SEQ ID No.1所示。

优选的，所述肿瘤包括结直肠肿瘤。