[发明专利]m6A相关lncRNA在预测小细胞肺癌预后和化疗反应的应用有效
申请号: | 202111215141.1 | 申请日: | 2021-10-19 |
公开(公告)号: | CN113957145B | 公开(公告)日: | 2023-09-26 |
发明(设计)人: | 赫捷;孙楠;张志慧;张超奇;吴芃;张国超 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100021 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | m6a 相关 lncrna 预测 细胞 肺癌 预后 化疗 反应 应用 | ||
本发明公开了m6A相关lncRNA在预测小细胞肺癌预后和化疗反应的应用。本发明所要保护的一个技术方案是检测WARS2‑IT1、AC005162、AC130352、AC015971、FOXP1‑IT1、AC040963和LINC00355七种lncRNA的表达量的物质在制备预测小细胞肺癌患者预后的系统和/或化疗获益的系统中的应用。通过将所述七种lncRNA基因表达量数据进行处理得到待测患者的风险值,并计算确定风险值的阈值,根据所述阈值可判断待预测小细胞肺癌患者的预后和化疗获益情况。该发明可为未来化疗在SCLC患者中的临床应用提供参考依据,将有助于提高临床小细胞肺癌的治疗疗效。
技术领域
本发明涉及生物医学领域,具体涉及m6A相关lncRNA在预测小细胞肺癌预后和化疗反应的应用。
背景技术
小细胞肺癌(Small cell lung cancer,SCLC)是高致死性的高级别神经内分泌肿瘤,其特点在于肿瘤倍增时间短、生长迅速和早期转移扩散。SCLC约占肺癌的15%,患者五年生存率不足7%。尽管分子靶向药物、免疫检查点抑制剂等新的治疗措施不断发展,小细胞肺癌患者的治疗策略近几十年仍未有明显的突破,化疗仍然是小细胞肺癌患者不可替代的一线治疗方案。然而,大多数小细胞肺癌患者即使对化疗敏感,但治疗后快速产生耐药。且患者病情进展迅速,极易发生转移,治疗手段十分有限。因此,临床亟需精准筛选预测化疗获益及预后的标志物,以便提高患者治疗效果,提高患者的预后。
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物RNA中最丰富和最普遍的RNA修饰,是癌症生物学的重要组成部分。m6A相关的生物学过程是动态、多层面、可逆的过程,主要由甲基化酶、甲基转移酶和结合蛋白介导功能的发挥。该修饰方式可以调控多种RNA相关的生物学进程,包括RNA降解、稳定、翻译、剪切和运输,最终调节靶基因的表达。
长链非编码RNA(Long-coding RNAs,lncRNAs)是核苷酸长度长于200的RNA亚群。LncRNAs参与m6A调节的肿瘤的发生和发展。m6A和lncRNA都参与多项生物学进程,具有预测患者预后和治疗靶点的潜力,而二者之间相关性的研究少之又少。综上所述,鉴于小细胞肺癌的高度恶性、有限的治疗措施和较差的预后,识别并建立小细胞肺癌的预后预测和化疗获益预测标志物意义重大。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何预测小细胞肺癌预后和/或化疗反应和/或确定小细胞肺癌的预后预测和/或化疗反应预测的标志物。
为了解决上述技术问题,本发明首先提供了检测WARS2-IT1、AC005162、AC130352、AC015971、FOXP1-IT1、AC040963和LINC00355这七种lncRNA的表达量的物质在制备预测小细胞肺癌患者预后的系统和/或预测小细胞肺癌患者化疗获益的系统中的应用。
上文所述应用中,所述WARS2-IT1可为WARS2-IT1(Gene ID:104472716,updatedon 24-Jul-2021)。所述AC005162可为AC005162(GenBank:AC005162.1,updated on 31-JAN-2004)。所述AC130352可为AC130352(GenBank:AC130352.6,updated on 13-DEC-2002)。所述AC015971(GenBank:AC015971.4,updated on 16-APR-2005)。所述FOXP1-IT1可为FOXP1-IT1(Gene ID:100506815,updated on 24-Jul-2021)。所述AC040963可为AC040963(GenBank:AC040963.6,updated on Jun-26-2002)。所述LINC00355可为LINC00355(Gene ID:144766,updated on 16-Aug-2021)。
上文所述应用中,所述物质可包括检测所述七种lncRNA基因的表达量所需的试剂和/或仪器。
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