[发明专利]用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的SNP分子标记及应用

说明书

本发明涉及用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的SNP分子标记，及其在鉴定和改良嘉兴黑猪母猪繁殖性能中的应用。所述SNP分子标记包括NR5A2基因外显子9第84609号位点，NR5A2基因外显子10第136706号位点、第136759号位点、第138802号位点和第138864号位点。本发明提供了用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的SNP分子标记，为提高嘉兴黑猪母猪繁殖性能提供潜在的遗传标记辅助选择，为嘉兴黑猪的选育提供了基础。

(一)技术领域

本发明涉及用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的SNP分子标记，及其在鉴定和改良嘉兴黑猪母猪繁殖性能中的应用。

(二)背景技术

猪繁殖性状是养猪业的重要经济性状，然而该性状属于低遗传力性状，遗传力在0.1左右。用常规育种方法，无法从根本上改良猪繁殖性状。随着分子生物学发展，通过现代分子育种技术对影响母猪繁殖性状的主效基因或相关开展遗传标记辅助选择，则可有效改善猪繁殖性状。

Y.X.Li等人对湖羊NR5A2进行了鉴定，并研究了NR5A2与繁殖性状的相关性。结果表明NR5A2 mRNA水平与湖羊排卵和产仔数呈正相关，并且在NR5A2的编码序列中检测到两个单核苷酸多态性(T40C和T1419C)，在第三胎和平均胎次时，T40位点CC基因型的母羊产仔数大于TT和TC基因型的母羊，T1419位点TT型母羊第三胎产仔数大于CC基因型母羊。YinxiaLi等人在NR5A2核心启动子区域(-700nt～-281nt)监测到位于-700nt的TG多态性，关联性分析发现GG型母羊第2胎和平均产羔数显著高于TG和TT型，GG型母羊第三代产羊羔数显著高于TT型母羊。此外Yinxia Li等人还发现-700TG多态性为金属调节转录因子1(MTF-1)创造了一个新的结合位点。竞争性电泳迁移改变分析证实MTF-1与NR5A2的G型启动子特异性结合。过表达实验证明，MTF-1参与了NR5A2转录活性的改变，并进一步增加了NR5A2基因mRNA的表达。NR5A亚家族中两个紧密相关的同源物SF-1(NR5A1)和LRH-1(NR5A2)先前已显示在粒细胞3中表达。NR5A1和NR5A2在小鼠粒细胞中类固醇的产生中起着相似的作用。Bertolin,K等人的研究表明NR5A2基因在调节山羊发情中的潜在作用，表明NR5A2在绵羊卵巢中起关键作用，是促进黄体生成的关键基因。Li,Y等人在湖羊NR5A1基因的核心启动子区域388处检测到C＞G突变，关联分析表明，GC型母羊的第二和第三羔羊数量要多于CC型母羊(P＜0.05)。Rihong Guo等人证实抑制Notch信号通过增强类固醇生成蛋白NPC1和STAR的表达来促进猪体内孕酮的分泌，NR5A2作为Notch信号的下游因子来调控孕酮的合成。KalyneBertolin等研究发现，NR5A2在卵泡发育过程中颗粒细胞中的卵丘扩张是必不可少的。上述结果表明NR5A2基因对猪的繁殖性能可能存在潜在作用。

(三)发明内容

本发明目的是提供用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的SNP分子标记，及其在鉴定和改良嘉兴黑猪母猪繁殖性能中的应用。

本发明采用的技术方案是：

用于鉴定嘉兴黑猪母猪繁殖性能的特异性SNP分子标记，包括NR5A2基因外显子9第84609号位点(G→A突变，产生GG、GA、AA三种基因型)，NR5A2基因外显子10第136706号位点(A→T突变，产生AA、AT、TT三种基因型)、第136759号位点(G→C突变，产生GG、GC、CC三种基因型)、第138802号位点(T→C突变，产生TT、TC、CC三种基因型)和第138864号位点(A→G突变，产生AA、AG、GG三种基因型)。