[发明专利]钾离子耐受的M-MLV逆转录酶突变体有效

专利信息
申请号: 202111174974.8 申请日: 2021-10-09
公开(公告)号: CN113913402B 公开(公告)日: 2022-05-20
发明(设计)人: 朱振宇;孙大鹏 申请(专利权)人: 武汉爱博泰克生物科技有限公司
主分类号: C12N9/12 分类号: C12N9/12;C12N15/54;C12N15/70;C12N15/74;C12P19/34;C12Q1/48
代理公司: 北京市中伦律师事务所 11410 代理人: 信建
地址: 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区高新二*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 离子 耐受 mlv 逆转录 突变体
【说明书】:

发明涉及生物技术领域,具体而言,涉及一种钾离子耐受的M‑MLV逆转录酶突变体。该逆转录酶突变体在野生型M‑MLV逆转录酶的基础上具有如下突变中的一种或多种:E275K、E441K、E596K和K658E;且具有显著提高的对高浓度钾离子的耐受性。

技术领域

本发明涉及生物技术领域,具体而言,涉及一种钾离子耐受的M-MLV逆转录酶突变体。

背景技术

逆转录酶(EC 2.7.7.49)最初被发现为负责RNA病毒基因组复制的酶。它可以使用RNA或单链DNA(ssDNA)作为模板,同时具有RNase H活性和DNA聚合酶活性。莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(M-MLV RT),因为其高催化活性和保真度,是目前互补DNA(cDNA)合成中使用最广泛的逆转录酶。M-MLV逆转录酶活性蛋白是一个75KDa大小的单体,其具有两个活性位点,其中一个位于N端结构域中以进行DNA聚合,另一个位于C端域中以实现RNase H活性。

目前,市售的M-MLV RT产品一般都提供含有KCl的第一链缓冲液。例如,来自Thermo Fisher Scientific和Promega的M-MLV RT带有5×第一链缓冲液,其中含有375mMKCl,这使得KCl的最终反应浓度达到75mM。此外,在样品处理或核酸提取过程中,许多抑制剂可能会被带入RNA样品中。比如,氯化钠和氯化钾是可能会残留在RNA样品中的常见盐类,它们会抑制随后的逆转录反应的过程。研究发现将KCl从15mM增加到75mM会增加逆转录酶-寡核苷酸解结合的表观速率常数(0.2–1.5s-1)。此外,钾(K+)可以与DNA骨架上的磷酸基团(P-)结合并稳定双链体形成和引物退火。大量的K+和PCR和RT-PCR反应中常见的Mg2+成分结合起来会大大降低PCR和RT-PCR反应的特异性。目前的一种替代解决方案是基于铵离子(NH4+)会破坏错配的引物-模板碱基配对之间的弱氢键,所以使用硫酸铵(NH4)2SO4代替缓冲液中的KCl来增强特异性。然而,硫酸铵并非适用于所有不同的Taq聚合酶或逆转录酶。因此,耐受大量KCl的新M-MLV RT突变体不仅可以提高反应效率的同时也可以减少RT反应对复杂的RNA样品纯化处理步骤的依赖。

发明内容

本发明的目的在于提供一种逆转录酶突变体,其氨基酸序列在SEQ ID NO:1所示的莫洛尼鼠白血病病毒(M-MLV)逆转录酶的基础上具有如下突变中的一种或多种:

E275K、E441K、E596K和K658E。

上述逆转录酶突变体相对于未发生相应突变的M-MLV逆转录酶,具有显著提高的对高浓度钾离子的耐受性,因而可以无需过多顾虑RNA样品中残留的钾离子的影响,具有更广阔的应用前景。

本发明还涉及分离的核酸,其编码如上所述的逆转录酶突变体,以及包含如上所述核酸的载体。

本发明还涉及宿主细胞,其基因组中掺有如上所述的核酸,或被如上所述的载体所转化。

本发明还涉及生产逆转录酶突变体的方法,包括:

a)培养如上所述的宿主细胞;

b)表达所述逆转录酶突变体;并

c)由所述宿主细胞分离所述逆转录酶突变体。

本发明还涉及试剂盒,其包含如上所述的逆转录酶突变体。

本发明还涉及组合物,其由如上所述的试剂盒中的各成分混合得到。

本发明还涉及用于逆转录一种或多种核酸分子的方法,包括:

i)使用如上所述的逆转录酶突变体与模板RNA接触,并且

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