[发明专利]用于检测番茄灰叶斑病抗性的SNP位点组合及其应用

权利要求书

1.一种SNP位点组合在检测或辅助检测番茄灰叶斑病抗性的应用，其特征在于，所述SNP位点组合包括位于番茄灰叶斑病抗性基因Sm内部及两侧的以下SNP位点：

SNP03位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9241397个核苷酸位点，其碱基为T或C；

SNP04位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9246838个核苷酸位点，其碱基为C或T；

SNP05位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9306833个核苷酸位点，其碱基为T或C；

SNP07位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9318930个核苷酸位点，其碱基为C或T；

SNP09位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9333469个核苷酸位点，其碱基为T或C；

SNP10位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9334124个核苷酸位点，其碱基为A或G；以及

SNP11位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9335134个核苷酸位点，其碱基为A或G。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述SNP位点组合还包括以下SNP位点的一个或多个：

SNP01位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9318832个核苷酸位点，其碱基为G或A；

SNP02位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9243756个核苷酸位点，其碱基为C或T；

SNP06位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9314583个核苷酸位点，其碱基为T或C；

SNP08位点，位于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本11号染色体上第9322852个核苷酸位点，其碱基为G或A。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述SNP01位点～SNP11位点及其各自的侧翼序列分别如SEQ ID No：1～11所示，所述SNP01位点～SNP11位点分别位于所述SEQ IDNo：1～11序列中的第102位。

4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述应用包括：

(1)在制备检测或辅助检测番茄灰叶斑病抗性的产品中的应用；

(2)在番茄灰叶斑病抗性育种中的应用；

(3)在番茄种质资源及新品种鉴定和保护中的应用；

(4)在番茄种质资源改良和创新中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述应用采用以下技术手段进行：

检测所述的SNP位点组合中的SNP位点的多态性或基因型，检测方法包括飞行质谱、液相色谱、重测序、靶向测序和多重PCR测序中的一种或多种。

6.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述应用采用以下技术手段进行：

利用所述的SNP位点组合中的SNP位点的序列信息开发PCR标记和/或基因芯片，所述PCR标记包括PCR-RFLP标记、TaqMan标记、KASP标记、AS-PCR标记和HRM标记中的一种或多种。

7.一种用于检测番茄灰叶斑病抗性的SNP位点组合的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括以下引物组：

引物组01：SEQ ID No：12～14序列；

引物组02：SEQ ID No：15～17序列；

引物组03：SEQ ID No：18～20序列；

引物组04：SEQ ID No：21～23序列；

引物组05：SEQ ID No：24～26序列；

引物组06：SEQ ID No：27～29序列；

引物组07：SEQ ID No：30～32序列。