[发明专利]用于检测番茄黄化曲叶病毒病抗性的SNP位点组合及其应用有效
| 申请号： | 202111164271.7 | 申请日： | 2021-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN113736866B | 公开（公告）日： | 2022-06-24 |
| 发明（设计）人： | 黄三文;吴坤;张金喆;练群;胡勇 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院农业基因组研究所;中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858;C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳市韦恩肯知识产权代理有限公司 44375 | 代理人： | 李华双 |
| 地址： | 518124 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 检测 番茄 黄化 病毒 抗性 snp 组合 及其 应用 | ||
1.一种SNP位点组合在检测或辅助检测番茄黄化曲叶病毒病抗性的应用，其特征在于，所述SNP位点组合包括位于番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-1内部及两侧的第一SNP位点组合和位于番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-2内部及两侧的第二SNP位点组合，所述第一SNP位点组合包括以下Ty1-SNP02位点、Ty1-SNP04位点、Ty1-SNP05位点、Ty1-SNP06位点以及Ty1-SNP08位点中的一种或多种，所述第二SNP位点组合包括以下Ty2-SNP04位点、Ty2-SNP05位点、Ty2-SNP07位点以及Ty2-SNP08位点中的一种或多种：
编号 基因 染色体 SNP物理位置 等位基因 Ty1-SNP02 Ty-1 Chr06 34385952 T或C Ty1-SNP04 Ty-1 Chr06 34361543 C或T Ty1-SNP05 Ty-1 Chr06 34378550 A或G Ty1-SNP06 Ty-1 Chr06 34385942 T或C Ty1-SNP08 Ty-1 Chr06 34387918 G或A Ty2-SNP04 Ty-2 Chr11 54290582 T或C Ty2-SNP05 Ty-2 Chr11 54288056 C或G Ty2-SNP07 Ty-2 Chr11 54288729 T或C Ty2-SNP08 Ty-2 Chr11 54289564 A或G
表中，基因序列及SNP物理位置信息对应于番茄Heinz 1706参考基因组SL2.50版本。
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