[发明专利]一种用于氨基糖苷类药物基因突变检测的试剂盒在审
申请号: | 202111157991.0 | 申请日: | 2021-09-30 |
公开(公告)号: | CN113637743A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 黄守锋 | 申请(专利权)人: | 苏州源河医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;G16B20/50;G06K9/62 |
代理公司: | 上海领匠知识产权代理有限公司 31404 | 代理人: | 汤蔚莉 |
地址: | 215151 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 氨基 糖苷 类药物 基因突变 检测 试剂盒 | ||
1.一种用于氨基糖苷类药物基因突变检测的试剂盒,其特征在于:
包括氨基糖苷类药物相关基因MT-RNR1上的两个突变位点m.1494CT和m.1555AG。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述突变位点每个设计1个探针,正义链和反义链方向均可设计,其核苷酸序列如SEQID No.1~ SEQ ID No.2所示。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述探针通过与含有m.1494CT和m.1555AG的DNA片段以碱基互补配对原则进行杂交发挥作用。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述探针通过检测后会得到两种检测值m和n,通过对m和n值进行计算,可得到mm、mn和nn三种基因分型结果,其中mm和nn代表纯和类型,生物学意义上的正常型或纯合型,需根据实际情况判读属于正常型或纯合型,mn代表杂合型;计算公式如下:
f(t)=(m-n)/(m+n)
当f(t)≈1±0.05时,分型结果为mm;
当f(t)≈-1±0.05时,分型结果为nn;
当f(t)≈0±0.05时,分型结果为mn;
进一步的,对基因分型结果进行聚类,计算公式如下:
f(x)=log2(m/n);
f(y)=[log2(m)+log2(n)]/2;
然后以f(x)为横轴,f(y)为纵轴进行聚类,根据样本分型结果和聚类数目判断检测结果属于阳性还是阴性。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述试剂盒还包括变性混合液、扩增混合液、片段化混合液、沉淀混合液和杂交混合液。
6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述试剂盒在CNVPLUS®微阵列芯片扫描仪中进行检测使用。
7.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
包括以下实施步骤:
S1、DNA扩增;
S2、DNA片段化和沉淀;
S3、干燥、重悬及质控;
S4、变性和杂交;
S5、芯片扫描仪检测。
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