[发明专利]一种用于氨基糖苷类药物基因突变检测的试剂盒在审

专利信息
申请号: 202111157991.0 申请日: 2021-09-30
公开(公告)号: CN113637743A 公开(公告)日: 2021-11-12
发明(设计)人: 黄守锋 申请(专利权)人: 苏州源河医疗科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;G16B20/50;G06K9/62
代理公司: 上海领匠知识产权代理有限公司 31404 代理人: 汤蔚莉
地址: 215151 江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 氨基 糖苷 类药物 基因突变 检测 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用于氨基糖苷类药物基因突变检测的试剂盒,其特征在于:

包括氨基糖苷类药物相关基因MT-RNR1上的两个突变位点m.1494CT和m.1555AG。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

所述突变位点每个设计1个探针,正义链和反义链方向均可设计,其核苷酸序列如SEQID No.1~ SEQ ID No.2所示。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

所述探针通过与含有m.1494CT和m.1555AG的DNA片段以碱基互补配对原则进行杂交发挥作用。

4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

所述探针通过检测后会得到两种检测值m和n,通过对m和n值进行计算,可得到mm、mn和nn三种基因分型结果,其中mm和nn代表纯和类型,生物学意义上的正常型或纯合型,需根据实际情况判读属于正常型或纯合型,mn代表杂合型;计算公式如下:

f(t)=(m-n)/(m+n)

当f(t)≈1±0.05时,分型结果为mm;

当f(t)≈-1±0.05时,分型结果为nn;

当f(t)≈0±0.05时,分型结果为mn;

进一步的,对基因分型结果进行聚类,计算公式如下:

f(x)=log2(m/n);

f(y)=[log2(m)+log2(n)]/2;

然后以f(x)为横轴,f(y)为纵轴进行聚类,根据样本分型结果和聚类数目判断检测结果属于阳性还是阴性。

5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

所述试剂盒还包括变性混合液、扩增混合液、片段化混合液、沉淀混合液和杂交混合液。

6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

所述试剂盒在CNVPLUS®微阵列芯片扫描仪中进行检测使用。

7.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

包括以下实施步骤:

S1、DNA扩增;

S2、DNA片段化和沉淀;

S3、干燥、重悬及质控;

S4、变性和杂交;

S5、芯片扫描仪检测。

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