[发明专利]一种指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物、检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 202111137834.3 | 申请日: | 2021-09-27 |
公开(公告)号: | CN113718034A | 公开(公告)日: | 2021-11-30 |
发明(设计)人: | 吴令英;程海霞;梁磊磊 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京睿智保诚专利代理事务所(普通合伙) 11732 | 代理人: | 周新楣 |
地址: | 100021 *** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 指导 卵巢癌 耐药 患者 用药 疗效 评估 标志 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物,其特征在于,所述标志物包括ctDNA的突变频率。
2.根据权利要求1所述的标志物,其特征在于,通过Raceseq测序检测ctDNA的突变频率。
3.一种用于指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物的试剂盒,其特征在于,包括检测血浆样本中的ctDNA的突变频率的试剂。
4.一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)对肿瘤组织进行外显子测序,获得肿瘤组织标本中突变基因的信息;
(2)选取突变位点,对每个突变位点设计相应引物;
(3)提取血浆的cfDNA,进行甲基化建库,然后利用步骤(2)得到的引物进行Raceseq测序;
(4)分析Raceseq测序的测序结果获得ctDNA的突变频率。
5.根据权利要求4所述的一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,所述Raceseq测序的测序结果的分析方法为:将DNA插入片段长度相同、DNA插入片段两端断点、两端的锚定序列均相同的初始DNA单链测序数据回溯到一个分子簇;将插入片段长度一致并且除突变点外的序列一致、分子簇两端的锚定序列相同但位置相反的同一个起始DNA双链的分子簇标记为一对duplex分子簇;对某一突变来说,若至少有一对duplex分子簇支持,即判断为真,若无duplex分子簇支持,那么至少有4个分子簇支持,即判断为真。
6.根据权利要求5所述的一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,若Raceseq测序检出簇的个数≧4,则判定为真突变,若Raceseq测序检出簇的个数<4,则判定为假突变。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国医学科学院肿瘤医院,未经中国医学科学院肿瘤医院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202111137834.3/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种天线罩的最佳厚度的测量方法和系统
- 下一篇:一种家畜一体化养殖系统