[发明专利]一种指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物、检测试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 202111137834.3 申请日: 2021-09-27
公开(公告)号: CN113718034A 公开(公告)日: 2021-11-30
发明(设计)人: 吴令英;程海霞;梁磊磊 申请(专利权)人: 中国医学科学院肿瘤医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 北京睿智保诚专利代理事务所(普通合伙) 11732 代理人: 周新楣
地址: 100021 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 指导 卵巢癌 耐药 患者 用药 疗效 评估 标志 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物,其特征在于,所述标志物包括ctDNA的突变频率。

2.根据权利要求1所述的标志物,其特征在于,通过Raceseq测序检测ctDNA的突变频率。

3.一种用于指导卵巢癌铂耐药患者用药及疗效评估的标志物的试剂盒,其特征在于,包括检测血浆样本中的ctDNA的突变频率的试剂。

4.一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)对肿瘤组织进行外显子测序,获得肿瘤组织标本中突变基因的信息;

(2)选取突变位点,对每个突变位点设计相应引物;

(3)提取血浆的cfDNA,进行甲基化建库,然后利用步骤(2)得到的引物进行Raceseq测序;

(4)分析Raceseq测序的测序结果获得ctDNA的突变频率。

5.根据权利要求4所述的一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,所述Raceseq测序的测序结果的分析方法为:将DNA插入片段长度相同、DNA插入片段两端断点、两端的锚定序列均相同的初始DNA单链测序数据回溯到一个分子簇;将插入片段长度一致并且除突变点外的序列一致、分子簇两端的锚定序列相同但位置相反的同一个起始DNA双链的分子簇标记为一对duplex分子簇;对某一突变来说,若至少有一对duplex分子簇支持,即判断为真,若无duplex分子簇支持,那么至少有4个分子簇支持,即判断为真。

6.根据权利要求5所述的一种检测ctDNA的突变频率的方法,其特征在于,若Raceseq测序检出簇的个数≧4,则判定为真突变,若Raceseq测序检出簇的个数<4,则判定为假突变。

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