[发明专利]新的与衰老相关的circRNA、筛选方法及应用在审
申请号: | 202111081145.5 | 申请日: | 2021-09-15 |
公开(公告)号: | CN114015686A | 公开(公告)日: | 2022-02-08 |
发明(设计)人: | 宋兴辉;王琳琳;高子颖;邢月婷;李艳伟;刘双双;郭春;王佳佳;黄莹莹 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12Q1/6809;C12Q1/6883;C12N15/867;C12N5/10 |
代理公司: | 杭州天昊专利代理事务所(特殊普通合伙) 33283 | 代理人: | 何碧珩;卓彩霞 |
地址: | 310000 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 衰老 相关 circrna 筛选 方法 应用 | ||
本发明公开了新的与衰老相关的circRNA、筛选方法及应用,首选筛选得到了新的与衰老相关的circRNA,并对circRNA‑1783(circRNA‑ATXN2)进行了研究,构建了circRNA‑ATXN2过表达载体,并包装成慢病毒,对大鼠皮下脂肪来源的间充质干细胞进行感染,利用流式分选技术,获取空载体(vector‑GFP)和过表达circRNA‑ATXN2(circRNA‑ATXN2‑GFP)的细胞,进行功能检测实验。circRNA‑ATXN2对ADSCs起到抑制增殖,促进凋亡和脂肪分化的作用。circ‑ATXN2(circRNA‑1783)将是提高ADSCs的干细胞治疗能力和ADSCs的内源性修复过程能力的新的潜在靶点。
技术领域
本发明具体涉及新的与衰老相关的circRNA、筛选方法及应用。
背景技术
脂肪组织由多种类型的细胞组成,其中脂肪组织来源的间充质干细胞(ADSCs)是脂肪组织中含量较多的细胞,被认为是一种有前途的用于基于干细胞的治疗的再生医学的细胞来源。然而ADSCs的数量和功能会随着年龄的增长而下降,降低干细胞内源性修复过程的能力和影响以干细胞为基础的治疗。
circRNA是一种新的内源性非编码RNA。然而,环状RNA在ADSCs中的功能尚不清楚。
发明内容
针对上述情况,为克服现有技术的缺陷,本发明提供了新的与衰老相关的circRNA、筛选方法及应用。
为了实现上述目的,本发明提供以下技术方案:
新的与衰老相关的circRNA,包括circRNA-1783。
一种新的与衰老相关的circRNA的筛选方法,所述筛选方法能够用于筛选所述的circRNA,包括以下步骤:
(1)采集年轻组和年老组大鼠的皮下脂肪组织;
(2)分别提取年轻组和年老组大鼠的总RNA;
(3)纯化总RNA样本,其中RNA完整性号7.0;
(4)去除核糖体RNA;
(5)筛选circRNA的表达谱;
(6)通过R package-edgeR筛选两组间差异表达的环状RNA,其倍变幅≥2,p值≤0.05,
(7)进行GO和KEGG富集分析;设定筛选条件进行筛选,得到circRNA-1783。
进一步地,步骤(7)中的筛选条件为:(1)每一个样本均有表达量;(2)exons≥3;(3)有miRNA潜在靶点。
新的与衰老相关的circRNA在调控大鼠脂肪来源干细胞ADSCs增殖、凋亡及脂肪分化中的应用,所述circRNA为以上所述的circRNA。
新的与衰老相关的circRNA在提高ADSCs的干细胞治疗能力和ADSCs的内源性修复能力中的应用,所述circRNA为以上所述的circRNA。
本发明的有益效果是:
本发明筛选得到了新的与衰老相关的circRNA,并对circRNA-1783(circRNA-ATXN2)进行了研究,构建了circRNA-ATXN2过表达载体,并包装成慢病毒,对大鼠皮下脂肪来源的间充质干细胞进行感染,利用流式分选技术,获取空载体(vector-GFP)和过表达circRNA-ATXN2(circRNA-ATXN2-GFP)的细胞,进行功能检测实验。circRNA-ATXN2对ADSCs起到抑制增殖,促进凋亡和脂肪分化的作用。环状RNA,比如circ-ATXN2(circRNA-1783),将是提高ADSCs的干细胞治疗能力和ADSCs的内源性修复过程能力的新的潜在靶点。
附图说明
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