[发明专利]与结直肠癌预后相关的标志分子

说明书

本发明涉及与结直肠癌预后相关的标志分子，所述标志分子包括如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12以及SEQ ID NO:13所示的至少一个基因序列。本发明提供的标志分子与结直肠癌的预后密切相关，结直肠癌患者预后预测与分析提供了新策略。

技术领域

本发明涉及癌症治疗以及预后评价领域，具体涉及与结直肠癌预后相关的标志分子。

背景技术

结直肠癌(colorectal cancer，CRC)是指发生在结肠或直肠上的恶性肿瘤。如今，它约占全球所有诊断出的癌症和与癌症相关的死亡病例的10％，每年约有90万人因该病去世。CRC大部分是零星散发的，并且在很大程度上归因于西化的环境风险因素，例如肥胖、不良饮食习惯、饮酒和吸烟。其诊断主要是依靠结肠镜检查以及在结肠镜下取样进行病理确诊。结直肠癌在治疗上大多采取以手术治疗为主的综合治疗，相对于结肠癌，直肠癌对放疗的敏感性更高，效果更好一些。结直肠癌由于解剖位置关系复杂，彻底手术难度大，术后复发率高；结肠癌由于发生快和转移多而通常预后较差。

转录因子(TFs)是具有调节功能的蛋白质。它们通过识别基因上游的特定DNA序列来调节基因转录，从而在发育和分化中起关键作用。许多转录因子不仅影响细胞类型的决定和个体发育模式，还参与许多生物途径的调节(例如免疫应答)。大量研究表明，TFs与肿瘤的形成和治疗密切相关。以往研究都是利用少量样本的RNA-seq数据筛选与结直肠癌预后相关的基因集；很少关注转录因子在结直肠癌早期诊断与预后方面的提示作用；大多研究是基于已知的结直肠癌相关调控因子，结合测序数据或者文献报道挖掘与该调控因子具有显著上下游相关调控关系的基因或信号通路及其在结直肠癌中的调控作用，未有研究利用数据库大量癌症与癌旁样本的测序数据结合WGCNA分析筛选与结直肠癌预后相关的特征转录因子。因此，直接利用CRC相关的TFs来构建结直肠癌的预后模型可能为CRC的诊断和治疗提供新的思路。

发明内容

在过去十年中，新技术的飞速发展使我们能够快速获取大量的CRC生理和病理信息。加权基因共表达网络分析(WGCNA)是探索基因与表型之间复杂关系的有效方法。WGCNA的独特优势是其可将基因表达数据转换为共表达模块，从而深入了解可能负责人们感兴趣表型特征的信号网络。它不仅可以比较差异表达的基因，还可以帮助我们弄清楚不同共表达模块中基因间的相互作用。因此，本发明通过提取CRC癌症和癌旁组织中的差异表达基因，利用WGCNA分析来筛选疾病相关TFs，同时建立疾病预后风险模型，实现TFs靶标调控网络的构建。

本发明的第一目的在于提供分离的与结直肠癌预后相关的标志分子，包括：如SEQID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12以及SEQ IDNO:13所示的至少一个基因序列。

具体而言，本发明提供的与结直肠癌预后相关的标志分子可以是SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:13中的任意一个序列，也可以包括其中的任意两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个、十二个或全部十三个序列。

其中，如SEQ ID NO:1所示的基因序列，其编码的蛋白又名ZEB1。ZEB1是肿瘤上皮-间质转化的关键驱动因子，直接与CDH1启动子结合，抑制E-cadherin转录。目前，尚未见该基因序列与结直肠癌预后相关的报道。