[发明专利]一种β-地中海贫血诊断标志物及其应用

说明书

本发明公开了一种β‑地中海贫血诊断标志物及其应用，其中，所述β‑地中海贫血诊断标志物为HSPA1B基因甲基化。本发明首次发现了HSPA1B基因甲基化在β‑地中海贫血患者中的差异表达，通过检测所述HSPA1B基因甲基化水平，可以判断受试者是否患有β‑地中海贫血，为β‑地中海贫血的早期诊断提供分子手段。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种β-地中海贫血诊断标志物及其应用。

背景技术

地中海贫血是人类最常见的常染色体遗传性疾病，主要是由于珠蛋白基因缺失或者突变，导致珠蛋白肽链生物合成障碍，引起一种或几种珠蛋白肽链合成不足或完全缺失，临床上表现为慢性溶血性贫血。分子生物学的研究表明地中海贫血是由于珠蛋白基因的缺失或突变所致。临床上主要分为α地中海贫血和β地中海贫血，还包括少数的δβ和δ类型地中海贫血。β-地中海贫血又可分为轻型、中间型和重型3种，表现为不同程度的进行性溶血性贫血、黄疸、肝脾肿大等，严重的会引起死亡。

目前许多血液病与表观遗传学的相关研究在国内外已经逐步展开，主要集中于白血病、淋巴瘤、骨髓增生异常综合征及浆细胞疾病等领域，而有关地中海贫血症表观遗传学发病机制的研究正处于起步阶段，并没有系统性展开。并且国内关于地中海贫血的研究主要集中在临床表现、产前诊断和地中海贫血的治疗等。现有技术对于儿童地中海贫血的诊断仅仅集中在一些常见的突变位点检测，对稀有位点突变或者新的基因突变患者很难做到明确的诊断。

因此，现有技术还有待于改进和发展。

发明内容

鉴于上述现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种β-地中海贫血诊断标志物及其应用，通过检测β-地中海贫血诊断标志物的表达水平可以判断受试者是否患有β-地中海贫血以及患β-地中海贫血的风险。

本发明的技术方案如下：

本发明提供了一种β-地中海贫血诊断标志物，其中，所述β-地中海贫血诊断标志物为HSPA1B基因甲基化。

本发明还提供了一种β-地中海贫血诊断标志物在制备β-地中海贫血诊断试剂中的应用。

进一步地，当所述HSPA1B基因甲基化表达水平上调时，受试者患有β -地中海贫血。

进一步地，所述β-地中海贫血诊断试剂包括检测HSPA1B基因甲基化水平的试剂。

有益效果：本发明首次发现了HSPA1B基因甲基化在β-地中海贫血患者中的差异表达，通过检测所述HSPA1B基因甲基化表达水平，可以判断受试者是否患有β-地中海贫血，为β-地中海贫血的早期诊断提供分子手段。

附图说明

图1为转录组测序中正常对照组和地贫组的差异基因图，图1中A为差异基因统计柱形图；图1中B为差异基因火山图。

图2为转录组测序中差异基因聚类热图。

图3为转录组测序中GO富集分析气泡图。

图4为转录组测序中KEGG富集分析气泡图。

图5为珠蛋白相关转录因子和表观遗传修饰酶表达情况对比图。

图6为甲基化测序差异位点分析和聚类图，其中，图6中A为CG碱基位点的甲基化率聚类分析图；B为差异性甲基化位点柱形统计图；C为差异性甲基化位点KEGG富集气泡图。

图7为甲基化测序差异性甲基化区域(MDR)分析图，其中，图7中A 为差异性甲基化区域柱形统计图；B为差异性甲基化区域GO富集分析气泡图。