[发明专利]一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法在审
| 申请号: | 202111026627.0 | 申请日: | 2021-09-02 |
| 公开(公告)号: | CN113723537A | 公开(公告)日: | 2021-11-30 |
| 发明(设计)人: | 睢丹;魏晨希;刘芃兰 | 申请(专利权)人: | 安阳师范学院 |
| 主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06F17/16 |
| 代理公司: | 北京睿智保诚专利代理事务所(普通合伙) 11732 | 代理人: | 韩迎之 |
| 地址: | 455000 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 对称 矩阵 分解 微生物 数据 方法 | ||
1.一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,具体步骤包括如下:
采集样本数据;
对所述样本数据构建样本相似性矩阵;
利用相似性网络融合算法来整合所述样本相似性矩阵,获得融合矩阵;
通过鲁棒的对称非负矩阵分解算法对所述融合矩阵进行聚类,为所述样本数据分配标签。
2.根据权利要求1所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,对于微生物组数据,采用高斯核函数构建样本相似性矩阵,公式为:
其中,vi表示第i个样本,wij表示样本i与样本j之间的相似性,||vi-vj||F为F范式,μ表示参数,μ=0.5,σij表示缩放参数,Eij表示第i个节点与第j个节点之间的距离,mean(E(j,Nj))表示第i个节点与其邻居之间距离的均值。
3.根据权利要求1所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,所述相似性网络融合算法的具体计算步骤为:
通过所述样本相似性矩阵得到标准化的亲邻矩阵;
利用KNN算法定义核矩阵;
以所述标准化的亲邻矩阵作为初始阶段,结合所述核矩阵,迭代更新亲邻矩阵,得到所述融合矩阵。
4.根据权利要求3所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,所述标准化的亲邻矩阵的计算公式为:
其中,wij表示样本i与样本j之间的相似性,wik表示样本i与样本k之间的相似性。
5.根据权利要求4所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,所述核矩阵的公式为:
其中,Ni表示第i个样本的邻域。
6.根据权利要求4所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,迭代更新亲邻矩阵的公式为:
其中,j是视角的数量,Mv表示第i个视角的核矩阵。
7.根据权利要求6所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,所述融合矩阵的公式为:
8.根据权利要求7所述的一种基于鲁棒的对称非负矩阵分解的微生物数据聚类方法,其特征在于,所述鲁棒的对称非负矩阵分解算法的公式为:
其中,S为对称矩阵,H、HT为低秩矩阵。
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