[发明专利]小麦单株穗数及耐热性性状相关SNP位点及其应用

权利要求书

1.一种试剂盒，用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性，所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第1875位碱基。

2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于：所述SNP位点处的核苷酸为G或C；所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为C/C纯合时，相对应的基因型是乙。

3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包含序列表中SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，和/或序列表中SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R。

4.一种引物，用于检测小麦基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性，所述的SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第1875位碱基；所述SNP位点处的核苷酸为G或C；所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为C/C纯合时，相对应的基因型是乙。

5.根据权利要求4所述的引物，其特征在于：所述引物为序列表中SEQ ID NO.2和SEQID NO.3组成的引物对1F和1R，和/或序列表中SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5组成的引物对2F和2R。

6.一种分子标记，其核苷酸序列为SEQ ID NO.1中5’末端1772-1899位序列，和/或其核苷酸序列为SEQ ID NO.1中5’末端1647-2001位序列。

7.权利要求1或2或3所述的试剂盒、权利要求4或5所述的引物、权利要求6所述的分子标记在鉴定或辅助鉴定小麦单株穗数及耐热性性状中的应用。

8.权利要求1或2或3所述的试剂盒、权利要求4或5所述的引物、权利要求6所述的分子标记在小麦育种中的应用。

9.一种鉴定或辅助鉴定小麦单株穗数及耐热性性状的方法，其特征在于：该方法包括如下步骤：

A、对待测小麦基因组DNA中任意一段包含如下SNP位点的DNA片段进行PCR扩增，并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定；所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第1875位碱基；

B、确定待测小麦的基因型，所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时，相对应的基因型是甲；所述SNP位点处的核苷酸为C/C纯合时，相对应的基因型是乙；

C、根据待测小麦基因型按照如下标准确定待测小麦的单株穗数及耐热性性状：C-1，单株穗数为：基因型甲纯合的小麦小于/候选小于基因型乙纯合的小麦；C-2，耐热性为：基因型甲纯合的小麦强于/候选强于基因型乙纯合的小麦。

10.根据权利要求9所述的鉴定或辅助鉴定小麦单株穗数及耐热性性状的方法，其特征在于：步骤A中：

所述的PCR扩增的DNA片段为SEQ ID NO.1中5’末端1772-1899bp；所述的PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，SEQ ID NO.4和SEQ IDNO.5组成的引物对2F和2R；

所述的酶切包括以下步骤：以小麦基因组DNA为模板，以引物1F和1R为引物对扩增得到PCR产物；将此PCR产物稀释100倍，以其作为模板，以引物2F和2R为引物对扩增得到PCR产物；用限制性内切酶SalI酶切PCR产物；

步骤B中：

若PCR产物不能被切开，则该核苷酸多态性位点为G/G，基因型为甲；若PCR产物可以被切开，则该核苷酸多态性位点为C/C，基因型为乙。