[发明专利]一种确定变应性鼻炎靶点的方法及应用在审

专利信息
申请号: 202110973402.X 申请日: 2021-08-24
公开(公告)号: CN113846152A 公开(公告)日: 2021-12-28
发明(设计)人: 冀德君;关兵 申请(专利权)人: 扬州良德抗体生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6809;G01N33/68;G01N33/48;G16B30/10;G16B25/00
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 马进
地址: 225012 江苏省扬州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 确定 变应性 鼻炎 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,包括如下步骤:

选取变应性鼻炎和健康人矫正手术者的部分下鼻甲组织,分别作为样本及对照组进行RNA提取和建库;

对建好的文库进行测序实验,获得患病原始单端序列和健康参考基因序列;

将患病原始单端序列和健康参考基因序列比对,进行基因表达定量分析; 基于定量分析的结果进行差异表达基因分析,确定变应性鼻炎靶点。

2.根据权利要求1所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述方法还包括检测血液免疫因子的ELISA方法和区分免疫细胞类群的流式细胞分析,验证确定的变应性鼻炎靶点。

3.根据权利要求1或2所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述变应性鼻炎靶点包括SYK信号。

4.根据权利要求1所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述序列比对使用Tophat软件进行比对,至少输出前200个比对结果。

5.根据权利要求1所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述基因表达定量分析是利用Cufflinks/RSEM进行表达定量估计。

6. 根据权利要求1所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述差异表达基因分析包括使用BLAST软件对差异表达基因序列与nr,Swiss-Prot,GO,COG和 KEGG数据库进行比对,获得差异表达基因的注释信息。

7.根据权利要求6所述的一种确定变应性鼻炎靶点的方法,其特征在于,所述注释信息包括差异表达基因参与的功能类型和信号通路情况。

8.一种确定变应性鼻炎靶点的应用,其特征在于,所述权利要求1-7任一项所述的方法,用于确定变应性鼻炎靶点。

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