[发明专利]一种小空间尺度传染病时空传播模式的预测方法有效

专利信息
申请号: 202110972763.2 申请日: 2021-08-24
公开(公告)号: CN113780635B 公开(公告)日: 2023-09-01
发明(设计)人: 马文军;杜庆锋;刘涛;肖建鹏;王培席;龚志均;肖菊姣;康敏;林立丰;宋铁;胡建雄;周燕;曾韦霖 申请(专利权)人: 广东省公共卫生研究院;广东省疾病预防控制中心;南方医科大学第七附属医院
主分类号: G16H50/80 分类号: G16H50/80;G16H50/50
代理公司: 广州市深研专利事务所(普通合伙) 44229 代理人: 姜若天
地址: 511430 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 空间 尺度 传染病 时空 传播 模式 预测 方法
【权利要求书】:

1.一种小空间尺度传染病时空传播模式的预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

A、收集整理传染病病例、流行病学调查数据、防控措施相关数据、社会人口地理数据以及手机通讯信令数据;

B、利用社会人口地理数据和手机通讯信令数据,估算研究区域1*1公里空间网格的居民出行OD矩阵;

C、利用疫情病例数据、流行病学调查数据以及防控措施数据,构建传染病疫情传播的SEIR模型;利用高维差分方程耦合传染病疫情传播和扩散过程,构建基于人口流动、融合非药物干预措施的小空间SEIR模型,该SEIR模型由以下六个公式组成:

;其中,Sj,t表示j网格第t天的易感者数,Sj,t-1表示j网格第t-1天的易感者数βt表示第t天的疾病传播概率,Ij,t-1表示j网格第t-1天的病例数,sr表示在保持社交距离的对应措施下戴口罩、不聚集的人群比例,tr表示在进行交通限制的对应措施下区域人口流动下降的比例,Nj,t-1表示j网格第t-1天的总人口数,Ijk,t-1表示j网格第t-1天流向k网格的病例数,k网格表示除j网格以外的其他网格,Mjk,t-1表示j网格第t-1天流向k网格的人口数;

;其中,Ej,t表示j网格第t天的潜伏期患者数,Ej,t-1表示j网格第t-1天的潜伏期患者数,ir表示在主动发现病例的对应措施下病例被发现并隔离的比例,a表示潜伏期患者转为病例的速率;

;其中,Ij,t表示j网格第t天的病例数,Ij,t-1表示j网格第t-1天的病例数,γ表示病例移除的速率;

;其中,Rj,t表示j网格第t天的移出者数,Rj,t-1表示j网格第t-1天的移出者数;

;其中,Nj,t表示j网格第t天的总人口数;

;其中,Ijk,t表示j网格第t天流向k网格的病例数,Mj,i,t表示每第tj网格流向i网格的人口数,i表示单个具体的网格,Nj,t表示第tj网格的总人口数;

D、将构建的SEIR模型与估算的居民出行OD矩阵相融合,形成基于人口流动、融合非药物干预措施的小空间尺度的传染病疫情传播SEIR模型;D1、根据现有的文献和实际流调数据,对SEIR模型未知参数设置一定范围作为候选参数;同时以当日实际新增发病人数为Poisson分布的参数;

D2、基于时依Poisson分布随机数和当前候选参数,采用4阶Runge-Kutta方法进行数值求解;

D3、拟合当地疫情首例病例后两周的每日新增发病人数Ti,较之实际值Ai,计算均方根偏差;

E、采取不同干预措施应对传染病疫情场景,预测不同情景下未来1-2个月疫情时空扩散趋势、累计病例数以及疫情结束时间。

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