[发明专利]一种BCR-ABL基因融合检测的校准品和参考品的制备方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202110962099.3 申请日: 2021-08-20
公开(公告)号: CN113667751A 公开(公告)日: 2021-11-19
发明(设计)人: 程雪涛;王洁;张亚飞 申请(专利权)人: 迈杰转化医学研究(苏州)有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 边人洲
地址: 215000 江苏省苏州市苏州工*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 bcr abl 基因 融合 检测 校准 参考 制备 方法 及其 应用
【说明书】:

发明提供了一种BCR‑ABL基因融合检测的校准品和参考品的制备方法及其应用,方法包括:分别制备ABL野生型装甲RNA和BCR‑ABL融合型装甲RNA;使用保护稀释液分别对所述ABL野生型装甲RNA和BCR‑ABL融合型装甲RNA进行溶解;通过数字PCR对所述ABL野生型装甲RNA和BCR‑ABL融合型装甲RNA的浓度进行检测;使用保护稀释液对所述ABL野生型装甲RNA和BCR‑ABL融合型装甲RNA进行梯度稀释,得到校准品;将ABL野生型装甲RNA校准品和BCR‑ABL融合型装甲RNA校准品按比例混合,得到参考品。制得的校准品和参考品与WHO一级标准品溯源性好,结果准确。

技术领域

本发明属于生物技术领域,尤其涉及一种BCR-ABL基因融合检测的校准品和参考品的制备方法及其应用。

背景技术

慢性髓系白血病(CML)是一种以中晚幼粒细胞恶性增殖为特征的疾病,约90%~95%的CML患者中可检测到BCR-ABL融合基因(即9号染色体上的ABL基因易位到22号染色体上的BCR基因上形成融合基因),可用于CML的分型诊断、疗效评价,以及作为微小残留病的检测和预后评估的可靠指标。

目前,临床常用检测方法包括常规染色体分析、荧光原位杂交(FISH)和荧光定量PCR。NCCN指南推荐CML患者达到CCyR(完全细胞学缓解)后应该每三个月进行一次BCR-ABL荧光定量PCR检测,用来监测残留白血病细胞有否上升、下降或处于稳定状态。

目前,BCR-ABL荧光定量PCR检测已国际标准化,考虑到实验的不同条件(如不同的参考基因、PCR引物、提取方法及荧光定量PCR体系、反转录体系等)的差异,各实验室的检测结果需和WHO一级标准品进行比对,并建立转换系数(CF),从而将BCR-ABL的定量结果转换成国际标准值(IS)。

然而,WHO一级标准品货期漫长,手续繁多,且经过提取后获得的RNA量很少,不能满足企业的研发、验证及质检的需求。此外,现有技术往往不能与WHO一级参考品进行溯源,定量结果缺乏可靠性;或即使能溯源,但和理论值差异较大;或不同的参考品制备批次间存在较大的批间差异,不能保持良好的一致性。

因此,如何提供一种容易获取的校准品及参考品,可以用于试剂的研发、验证及质检中,已成为亟待解决的问题。

发明内容

针对现有技术的不足和实际需求,本发明提供一种BCR-ABL基因融合检测的校准品和参考品的制备方法及其应用,制备得到的校准品和参考品具有良好的扩增效率,批间差异小,可以与WHO一级标准品进行很好的溯源,校正系数十分接近1.0(即检测值等同于理论值),应用价值极高。

为达此目的,本发明采用如下技术方案:

第一方面,本发明提供了一种BCR-ABL基因融合检测的校准品和参考品的制备方法,所述制备方法包括:

分别制备ABL野生型装甲RNA和BCR-ABL融合型装甲RNA;

使用保护稀释液分别对所述ABL野生型装甲RNA和BCR-ABL融合型装甲RNA进行溶解;

通过数字PCR对所述ABL野生型装甲RNA和BCR-ABL融合型装甲RNA的浓度进行检测;

使用保护稀释液对所述ABL野生型装甲RNA和BCR-ABL融合型装甲RNA进行梯度稀释,得到校准品;将ABL野生型装甲RNA校准品和BCR-ABL融合型装甲RNA校准品按比例混合,得到参考品。

本发明中,选用装甲RNA用于制备校准品及参考品,可以与WHO一级标准品在核酸层面保持一致;加入保护稀释液,可以提高并稳定反应的扩增效率,减少或消除批间差异;选用数字PCR进行检测,对于装甲RNA的定量检测更准确;制备得到的校准品和参考品能够与WHO一级标准品进行很好的溯源,校正系数十分接近1.0。

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