[发明专利]一种与肿瘤相关的长链非编码RNA及其cDNA和应用

说明书

本发明涉及生物医药领域，公开了一种与肿瘤相关的长链非编码RNA、其cDNA和应用。该长链非编码RNA或者其cDNA能够作为肿瘤分子标志物，或者药物的靶点，可用来调控MYB基因的表达，并调控白血病细胞的增殖，可作为白血病检测的标志物和治疗的靶点。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，具体涉及一种与肿瘤相关的长链非编码RNA、其cDNA和应用。

背景技术

MYB是一种原癌基因和重要的转录因子，在细胞的增殖、分化、凋亡等重要生命过程和多种疾病中发挥重要作用。现有的研究表明，MYB转录失调或突变可诱发癌变，主要为白血病，包括急性髓系白血病(AML)、慢性髓系白血病 (CML)和急性淋巴细胞白血病(ALL)等。在人的T淋巴细胞白血病病人的基因组中发现，MYB基因存在基因转座及拷贝数增加。此外，在人的结直肠癌和乳腺癌中也发现MYB的表达显著升高。

已有研究发现，MYB上游存在增强子元件，可以与MYB启动子空间上靠近并形成DNA-loop环，并通过募集转录因子和结构蛋白远端调控MYB的表达。因此，调控MYB的表达量可能有助于治疗肿瘤，且MYB的转录受其上游区域的非编码区调控。

白血病的治疗方法多样，包括放化疗、干细胞移植以及免疫治疗等，这些治疗方法在一定程度上可以缓解病程，然而疾病的完全缓解率较低，且白血病还具有易复发的特点，这也增加了治疗难度。因此，寻找新的治疗靶点和治疗方法对白血病的治疗具有重要的意义。

长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)是指长度大于200nt，不翻译成多肽的RNA，lncRNA种类丰富，功能复杂，具有多种生物学特性。研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰等多种重要的调控过程。多种lncRNA在人类癌细胞中异常表达，与癌症的发生、发展以及转移密切相关。因此，lncRNA可能成为白血病的治疗靶点和生物标志物，深入研究lncRNA在白血病中的作用及机制有望为白血病的诊断及治疗提供新方法。

发明内容

本发明旨在提供一种与肿瘤相关的长链非编码RNA及其cDNA，并用来调控MYB的表达，将其用作肿瘤尤其是白血病检测的标志物和治疗靶点。

本发明的技术方案为：

一种与肿瘤相关的长链非编码RNA(简称MYB-34KAS)及其cDNA，长链非编码RNA由MYB基因上游34kb区域转录，cDNA的核苷酸序列包含SEQ ID No.1所示的序列。

优选的，所述长链非编码RNA的cDNA为SEQ ID No.1所示核苷酸序列。

用于扩增上述长链非编码RNA或者其cDNA的引物，其上游引物和下游引物，分别包括SEQ ID No.2和SEQ ID No.3的序列；优选的，其上游引物和下游引物分别如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。

上游引物(SEQ ID No.2)：5′-atgggagagaaactcagaacatttc-3′；

下游引物(SEQ ID No.3)：5’-ttaaattgtttattgttctctgttacatttaaaatg-3’

一种检测前述长链非编码RNA的表达丰度或者其cDNA序列的试剂盒，含有上述扩增引物。

一种重组载体或者转染载体，含有上述长链非编码RNA的cDNA序列，能够过表达或者敲降上述长链非编码RNA或者其cDNA。

重组载体为含有上述长链非编码RNA的cDNA序列的质粒，可以是过表达重组质粒或者敲降重组质粒。

重组载体的构建方法为：RACE技术扩增出cDNA全长序列后，连接到载体上，经过测序验证后，进行酶切位点PCR反应将cDNA全长序列从载体上转移到过表达质粒或敲降质粒上。