[发明专利]基于MassArray核酸质谱的脑胶质瘤染色体lp/19q检测方法及应用

说明书

本发明提供一种染色体lp/19q杂合性缺失的检测方法、试剂盒及引物组，该方法基于MassArray质谱平台对脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失进行检测，无需使用正常对照样本，即可完成脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失检测，同时增加19号染色体长臂上的检测位点，进一步提高脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失检测的准确性，检测分析操作简单、耗时短、准确性高、价格便宜，适于在临床中推广。

技术领域

本发明属于医疗检测技术领域，具体涉及一种染色体1p/19q杂合性缺失的检测方法、试剂盒及引物组。

背景技术

脑胶质瘤作为一种高病死率的恶性肿瘤，目前治疗手段虽有长足进步，但患者的中位生存期仍小于15个月，这一疾病在我国造成了巨大的社会经济及家庭负担。近年来，脑胶质瘤的分子病理研究取得了重大进展，已发现了一系列有助于脑胶质瘤临床诊断和预后判断的分子标志物，例如IDH1/2基因突变，lp/19q杂合性缺失突变(loss ofheterozygosity,LOH)，MGMT启动子甲基化等。染色体lp/19q杂合性缺失是指细胞中一条1号染色体短臂或/和一条19号染色体长臂发生缺失。目前认为lp/19q杂合性缺失是少突胶质细胞瘤的分子特征，是其诊断性分子标志物。通常对疑似少突胶质细胞瘤或混合性少突星形细胞瘤均应进行lp/19q杂合性缺失的检测，从而协助组织学的诊断。lp/19q杂合性缺失可以帮助区分混合性少突星形细胞瘤更倾向于少突还是星形，这对于治疗选择有一定的意义。存在lp/19q杂合性缺失的少突胶质细胞瘤生长速度较慢，并对化疗敏感。目前治疗指南对少突胶质细胞瘤均推荐检测lp/19q杂合性缺失的状态。

对于脑胶质瘤的lp/19q杂合性缺失突变，临床上常用的检测方法主要有荧光原位杂交(FISH)、基于杂合性缺失分析的聚合酶链式反应(PCR-L0H)、阵列比较基因组杂交(CGH)。《中国脑胶质分子诊疗指南》推荐FISH作为检测lp/19q杂合性缺失的方法，虽然FISH技术可通过荧光信号直观地显示lp/19q的缺失状态，但是探针结合区域的局限性使得小范围的缺失可能检测不出，而且FISH实验操作比较复杂，对操作和结果分析人员的经验要求非常高，检测周期长、配套仪器和试剂价格昂贵oPCR-LOH对Ip和19q上的多个微卫星区域进行扩增后，需通过变性聚丙烯酰胺电泳或变性高效液相色谱等方法来检测扩增产物，整个实验流程操作复杂、容易发生污染、结果分析掺杂因素多，不利于临床使用。CGH需使用进口的基因芯片，配套的仪器和试剂耗材成本较高。因此，目前对于胶质细胞瘤的lp/19q杂合性缺失突变检测，缺乏一种操作简单、耗时短、准确性高、价格便宜的检测方法。申请人早期专利中涉及一种基于MassArray核酸质谱平台的脑胶质瘤染色体lp/19q的检测方法，不过该方法仍需进一步提升。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的是寻求一种检测通量更高、操作更简便、成本更低的检测脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失的产品及其方法。为实现该目的，本发明针对申请人早期的专利CN201810842077.1进行升级改造，进而克服上述问题。为实现上述目的，本发明主要提供图下技术方案：

本发明提供上述的用于检测脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失相关SNP位点的引物组，在制备检测脑胶质瘤检测产品中应用。

本发明提供一种用于检测脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失的产品，以缓解现有技术中缺少能够高通量、易操作且低成本的针对脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失进行检测的产品的技术问题。

本发明提供一种检测脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失相关SNP位点的方法，以缓解现有的检测方法通量较低、操作繁琐、价格昂贵等技术问题。

本发明还提供了一种用于检测脑胶质瘤染色体lp/19q杂合性缺失的产品，所述产品包括所述产品包括用于检测SNP位点的试剂和/或设备，以及上述的引物组。