[发明专利]一种鉴别罗氏鼢鼠的试剂盒及方法有效
申请号: | 202110944099.0 | 申请日: | 2021-08-17 |
公开(公告)号: | CN113430282B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 张婧捷;蔡振媛;张同作;雅琴;江峰;高红梅;宋鹏飞;徐波;侯陆一 | 申请(专利权)人: | 中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 魏静;张娟 |
地址: | 810000 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 罗氏鼢鼠 试剂盒 方法 | ||
本发明提供了一种鉴别罗氏鼢鼠的试剂盒及方法,属于鉴定技术领域。该试剂盒包括检测待检物种的16S rRNA基因中如下SNP位点的试剂:SEQID NO:3所示保守motif序列的第34位。本发明提供了一种简便、准确鉴定罗氏鼢鼠物种的试剂盒以及鉴定罗氏鼢鼠的方法,解决了通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题,在鼢鼠的物种鉴别中具有优异的应用前景。
技术领域
本发明属于鉴定技术领域,具体涉及一种鉴别罗氏鼢鼠的试剂盒及方法。
背景技术
鼢鼠是鼢鼠亚科(Myospalacinae)动物的统称,主要分布于中国和西伯利亚南部地区。现存鼢鼠包括凸颅鼢鼠属(Eospalax)和平颅鼢鼠属(Myspalax),我国几乎分布了所有现生鼢鼠物种。平颅鼢鼠包括草原鼢鼠(M.aspalax)和东北鼢鼠(M.psilurus)等2-3个物种,凸颅鼢鼠属只分布在我国,包括中华鼢鼠(E.fontanieri)、斯氏鼢鼠(E.smithi)、罗氏鼢鼠(E.rothschildi)、高原鼢鼠(E.baileyi)、甘肃鼢鼠(E.cansus)和秦岭鼢鼠(E.rufescens)等6个物种。
罗氏鼢鼠主要分布在我国的湖北、四川东部以及陕西南部。罗氏鼢鼠主要栖息在海拔1500米以上的华山松幼林地、苗圃地、农耕地及草地下,拱洞筑巢,营地下生活。罗氏鼢鼠成鼠体长150-215毫米,体重114-365克。体粗壮呈圆筒形,毛细而密,夏毛基部灰黑色,毛尖黄色,成体呈棕黄色或锈红色,由体侧至腹部毛色渐淡。有的整个体背及两侧均为明显的锈红色,腹部均为灰黑色,在毛尖部分稍带锈红色。头宽而扁,鼻尖平钝,下唇毛色乳白,多数额部中央有明显的白色毛斑,眼极小,耳壳不发达,常被覆于绒毛之下。四肢短而粗壮,并具尖锐的爪,前足爪较后足爪发达,向外弯曲呈镰刀状。尾短小,被短毛,端部白色。
鼢鼠几乎终生都生活在密闭的地下洞道系统中,独特的地下生活方式使得其在觅食、婚配、繁殖等多方面具有特殊性,引起了科学家的广泛兴趣。识别鉴定生物种类是认识和保护生物多样性的基础,每种生物只有能够被准确识别后,才能开展更多领域的研究。但是由于不同鼢鼠生活环境相似而形态趋同,未经专业训练通过形态进行物种准确鉴定非常困难。
因此,研究一种能够快速、准确进行罗氏鼢鼠物种鉴定的方法与试剂,具有非常重要的意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种能够简便、准确鉴定罗氏鼢鼠物种的试剂盒和方法,解决通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题。
本发明提供了一种鉴别罗氏鼢鼠的试剂盒,所述试剂盒包括检测待检物种的16SrRNA基因中的如下SNP位点的试剂:SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第34位。
进一步地,所述SNP位点的碱基如下:SEQ ID NO:3所示保守motif序列的第34位碱基为A。
进一步地,所述试剂为测序用试剂、KASP方法用试剂或限制性片段长度多态性方法用试剂。
进一步地,所述试剂盒还包括扩增16S rRNA基因保守motif序列的试剂;所述保守motif序列为SEQ ID NO:3所示的序列。
进一步地,所述扩增16S rRNA基因保守motif序列的试剂包括SEQ ID NO:1~2所示的引物对。
本发明还提供了扩增16S rRNA基因保守motif序列的试剂在制备鉴别罗氏鼢鼠的试剂盒中的用途,所述保守motif序列是SEQ ID NO:3所示的序列。
进一步地,所述扩增16S rRNA基因保守motif序列的试剂包括SEQ ID NO:1~2所示的引物对。
本发明还提供了一种鉴别罗氏鼢鼠的方法,包括如下步骤:
(1)提取待检鼢鼠样本的基因组总DNA;
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