[发明专利]与水牛泌乳相关基因NTNG1及其作为分子标记的应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，公开了与水牛泌乳相关基因NTNG1及其作为分子标记的应用。本发明首次研究发现了NTNG1基因与水牛泌乳中的产奶量高/低相关联的位点，为选育具有优良性状的水牛品种提供候选基因。具体是两个位于NTNG1基因中与水牛产奶量相关的分子标记以及位于水牛第6号染色体上两段与该性状相关的选择信号区域及其应用。通过获得水牛SNP分型数据；基于iHS和XP‑EHH选择信号检测方法，鉴别出两段位于水牛第6号染色体上与水牛泌乳相关的选择信号区域，结合标记‑性状关联分析技术鉴定出两个与产奶性状相关的分子标记，利用该标记能针对水牛的水牛产奶量性状开展标记辅助选择。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及与水牛泌乳相关基因NTNG1及其作为分子标记的应用。

背景技术

选择信号策略是继候选基因法和全基因组关联分析技术之后又一发掘畜禽重要经济性状相关基因的研究工具。相比于候选基因法和全基因关联分析技术，该策略不需要严格的依赖表型数据就可以鉴定出与目标性状相关的基因。根据不同的技术原理，选择信号策略可以分为基于等位基因频率的方法、基于连锁不平衡的方法、基于群体分化的方法以及基于基因组杂合度的方法等4大类。本研究将利用基于连锁不平衡的方法（iHS和XP-EHH）对水牛泌乳性状相关基因进行发掘。

水牛是我国南方地区重要的特色奶用畜种，具有奶质优良，营养丰富，具有“奶中之王”值美称，深受消费者的喜爱。水牛可分为河流型和沼泽型水牛两个亚种，其中河流型水牛以乳肉兼用为主，是高产水牛群体的代表，而沼泽型水牛以役用为主，是低产水牛群体的代表。然而，较低的产奶性能已成为了影响水牛产业发展的重大科学问题。为了解决这一产业共性问题，我国从上世纪开始就从印度、巴基斯坦和意大利先后引进了摩拉、尼里-拉菲和地中海水牛，对我国的本土水牛进行了杂交改良，获得了一批杂交水牛，特别是该群体在产奶性能方面表现突出，大大提高了我国沼泽型水牛的泌乳性能。显然，逐步提高我国水牛的泌乳性能，培育专业化的水牛新品种是我国水牛育种科研工作者长期努力的目标。同样，挖掘与影响水牛泌乳相关致因基因已成为当前水牛科学研究的热点，对提高水牛的产奶性能具有重要的意义。

发明内容

本发明的发明目的在于：针对上述存在的问题，提供与水牛泌乳相关基因NTNG1及其作为分子标记的应用，并将该分子标记应用于筛选出产奶量高/低的水牛，为选育具有优良性状的水牛品种提供技术支撑。

为了实现上述目的，本发明采用的技术方案如下：

与水牛泌乳相关的SNP分子标记，所述水牛泌乳具体是指水牛产奶量，所述与水牛产奶量相关的分子遗传标记至少包括以下标记之一：

标记一：位于水牛第6号染色体的第35981116核酸位点，该位点的碱基为C或A，对应位于核酸序列表SEQ ID NO.1的第51位核酸位点；

标记二：位于水牛第6号染色体的第36003636核酸位点，该位点的碱基为G或A，对应位于核酸序列表SEQ ID NO.2的第51位核酸位点。

本发明还提供一种应用如上所述的SNP分子标记在选育或辅助选育与水牛泌乳相关的水牛品种或品系的用途，具体是选育或辅助选育水牛产奶量高/低的水牛。

本发明还提供一种应用如上所述的SNP分子标记选育或辅助选育与水牛泌乳相关的水牛品种或品系的方法，具体步骤为：提取水牛基因组DNA，检测水牛的第6号染色体的第35981116位核苷酸，检测出第35981116位核苷酸的序列为C或A，确定待测水牛的基因型是AA、AC或CC型，根据需要选择AC型基因的水牛进行下一步选种和/或育种；检测水牛的第6号染色体的第36003636位核苷酸，检测出第36003636位核苷酸的序列为G或A，确定待测水牛的基因型是GG、GA或AA型，根据需要选择GA型基因的水牛进行下一步选种和/或育种。

进一步说明，所述AC型基因的水牛产奶量高于AA或CC型基因水牛；所述GA型基因的水牛产奶量高于GG或AA型基因水牛。