[发明专利]一组诊断食管癌的甲基化标志物

说明书

本发明涉及生物技术、生物医药领域，具体涉及一组诊断食管癌的甲基化标志物；所述甲基化标志物组合包括以下至少一个甲基化位点：cg05446471、cg10085326、cg11926456、cg12126990、cg13480465、cg19310604、cg20473977、cg21041579、cg21553182、cg24276395、cg25724842、cg26033932。

技术领域

本发明涉及生物技术、生物医药领域，具体涉及一组诊断食管癌的甲基化标志物。

背景技术

DNA甲基化是哺乳动物中研究最深入的表观遗传调控系统之一，并且这种共价表观遗传标记的编写、读取和维持模式已得到全面阐述。CpG岛(CpG island，CGI)是富含CpG二核苷酸的DNA序列的延伸，存在于大多数哺乳动物启动子区域，通过对这些位置DNA甲基化的研究初步分析了甲基化与基因表达的调控关系。CpG岛的甲基化通常会导致长期稳定的基因沉默，然而在相应的表观遗传研究手段发展之前，位于启动子区域以外的DNA甲基化模式在多种动态生物学过程中的研究十分缺乏。目前，全基因组甲基化谱的相关研究已全面揭示了增强子、基因体和部分甲基化区域中DNA甲基化的动态改变，表明其在个体发育和疾病过程中的调控作用。虽然已有研究普遍认为DNA甲基化是一种抑制性的表观遗传标记，但其介导的转录抑制的调控机制尚未完全阐明。部分研究表明，DNA甲基化介导的转录调控可能涉及其与序列特异性转录因子间的相互作用。

食管癌是常见的消化道肿瘤，全世界每年约有30万人死于食管癌。其发病率和死亡率各国差异很大。我国是世界上食管癌高发地区之一，每年平均病死约15万人。男多于女，发病年龄多在40岁以上。食管癌早期症状常不明显，但在吞咽粗硬食物时可能有不同程度的不适感觉，包括咽下食物梗噎感，胸骨后烧灼样、针刺样或牵拉摩擦样疼痛。食物通过缓慢，并有停滞感或异物感。梗噎停滞感常通过吞咽水后缓解消失。症状时轻时重，进展缓慢。中晚期食管癌典型的症状为进行性咽下困难，先是难咽干的食物，继而是半流质食物，最后水和唾液也不能咽下。常吐黏液样痰，为下咽的唾液和食管的分泌物。患者逐渐消瘦、脱水、无力。持续胸痛或背痛表示为晚期症状，癌已侵犯食管外组织。当癌肿梗阻所引起的炎症水肿暂时消退，或部分癌肿脱落后，梗阻症状可暂时减轻，常误认为病情好转。若癌肿侵犯喉返神经，可出现声音嘶哑；若压迫颈交感神经节，可产生Horner综合征；若侵入气管、支气管，可形成食管、气管或支气管瘘，出现吞咽水或食物时剧烈呛咳，并发生呼吸系统感染。最后出现恶病质状态。若有肝、脑等脏器转移，可出现黄疸、腹腔积液、昏迷等状态。

我国在20世纪50年代末就开始了食管癌防治的研究，在高发区农村建立防治研究点。对高发区人群中采取宣教和应用食管细胞学诊断方法开展普查，以求早期发现、早期治疗，提高治愈率。

发明内容

诊断标志物组合

一方面，本发明提供了一种诊断食管癌的甲基化标志物组合，所述甲基化标志物组合包括以下至少一个甲基化位点：cg05446471、cg10085326、cg11926456、cg12126990、cg13480465、cg19310604、cg20473977、cg21041579、cg21553182、cg24276395、cg25724842、cg26033932。

优选地，所述甲基化标志物组合是以下甲基化位点的组合：cg05446471、cg10085326、cg11926456、cg12126990、cg13480465、cg19310604、cg20473977、cg21041579、cg21553182、cg24276395、cg25724842和cg26033932；具体地，以上甲基化位点在患者和健康者体内的甲基化程度是差异的(FDR值0.05)。

优选地，所述差异的包括患者体内的甲基化程度是健康者的至少1倍，或者患者体内的甲基化程度是健康者的10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％。