[发明专利]基于表型与SSR分子标记联合构建普通菜豆的指纹图谱有效
| 申请号: | 202110879961.4 | 申请日: | 2021-08-02 | 
| 公开(公告)号: | CN113373259B | 公开(公告)日: | 2022-04-05 | 
| 发明(设计)人: | 杜吉到;杜艳丽;赵强;张琦;夏春阳;李明;任心雨;王广达;张兆宁 | 申请(专利权)人: | 黑龙江八一农垦大学 | 
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 | 
| 代理公司: | 北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙) 11562 | 代理人: | 程小芳 | 
| 地址: | 163300 黑龙江省大庆市高*** | 国省代码: | 黑龙江;23 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 表型 ssr 分子 标记 联合 构建 普通 菜豆 指纹 图谱 | ||
1.一种用于鉴别菜豆的分子标记组合,其特征在于,所述分子标记包括PvSSR-01-1、PvSSR-02-1、PvSSR-02-2、PvSSR-03-1、PvSSR-03-2、PvSSR-04-1、PvSSR-04-2、PvSSR-05-1、PvSSR-05-2、PvSSR-06-1、PvSSR-06-2、PvSSR-07-1、PvSSR-07-2、PvSSR-08-1、PvSSR-08-2、PvSSR-09-1、PvSSR-09-2、PvSSR-10-1、PvSSR-10-2、PvSSR-11-1、PvSSR-11-2,所述分子标记分别通过如下引物对扩增得到:SEQ ID NO:1-2、SEQ ID NO:3-4、SEQ ID NO:5-6、SEQ IDNO:7-8、SEQ ID NO:9-10、SEQ ID NO:11-12、SEQ ID NO:13-14、SEQ ID NO:15-16、SEQ IDNO:17-18、SEQ ID NO:19-20、SEQ ID NO:21-22、SEQ ID NO:23-24、SEQ ID NO:25-26、SEQID NO:27-28、SEQ ID NO:29-30、SEQ ID NO:31-32、SEQ ID NO:33-34、SEQ ID NO:35-36、SEQ ID NO:37-38、SEQ ID NO:39-40、SEQ ID NO:41-42所示引物。
2.一种引物组合,其特征在于,包括21对特异性引物对,其核苷酸序列分别如SEQ IDNO:1-SEQ ID NO:42所示。
3.一种试剂盒,其特征在于,包含权利要求1所述的分子标记组合或者权利要求2所示的引物组合。
4.一种普通菜豆指纹图谱的构建方法,其特征在于,包括构建表型指纹图谱和DNA指纹图谱:
不同普通菜豆的花色,生长习性,结荚习性,荚色,荚面,种皮斑纹,种皮斑纹色,粒形性状被采集并进行编号,构建表型指纹图谱;
利用权利要求2所述的引物组合对不同品种普通菜豆的DNA进行PCR扩增,再对扩增产物进行电泳检测,根据电泳检测结果构建DNA指纹图谱;
所述表型指纹图谱和DNA指纹图谱组合构建成普通菜豆的指纹图谱;
所述普通菜豆品种为资源库号为YD001的红腰饭豆、资源库号为YD002的YD33、资源库号为YD003的黑豆Y124、资源库号为YD005的普通菜豆Y137、资源库号为YD006的日本白普通菜豆、资源库号为YD007的黑普通菜豆Y92、资源库号为YD008的黑普通菜豆Y120、资源库号为YD009的红普通菜豆F3389、资源库号为YD010的奶圆粒、资源库号为YD011的英国红、资源库号为YD012的菜豆12、资源库号为YD013的点滴褐13、资源库号为YD016的黑普通菜豆、资源库号为YD017的蒙古圆、资源库号为YD018的英国红普通菜豆Y84、资源库号为YD019的77、资源库号为YD020的Y10Y14、资源库号为YD022的英国红普通菜豆Y84-1、资源库号为YD023的普通菜豆Y80、资源库号为YD024的黑豆Y135、资源库号为YD025的紫花普通菜豆、资源库号为YD026的黑普通菜豆03、资源库号为YD027的Y09、资源库号为YD028的叙利亚奶花Y91、资源库号为YD029的英国红普通菜豆、资源库号为YD031的点滴褐31、资源库号为YD032的英国红普通菜豆Y84-2、资源库号为YD033的红菜豆33、资源库号为YD034的普通菜豆Y137和资源库号为YD035的普通菜豆Y80;所述普通菜豆品种名称及资源库号均来自国家杂粮工程技术研究中心种质资源库;
根据标准DNA分子量和引物的迁移率记录电泳结果,每对引物迁移率最大的条带记为1,迁移率次之的记为2,依次类推,无条带记为0,建立SSR基因型信息数据,按照引物顺序进行编码,得到的指纹代码即为该品种的特征指纹图谱。
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