[发明专利]一种与油茶单果质量相关的DNA片段及其应用在审
申请号: | 202110844658.0 | 申请日: | 2021-07-26 |
公开(公告)号: | CN113637787A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 常君;林萍;姚小华;王开良 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01H1/04 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 张璐 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 油茶 质量 相关 dna 片段 及其 应用 | ||
1.与油茶单果质量相关的DNA片段,其特征在于,其为位于油茶连锁图谱10号连锁群的wsf.10-2;置信区间为198.095cM-205.399cM。
2.与油茶单果质量位点紧密连锁的SNP分子标记,其特征在于,包括SNP分子标记Chr10-85853737,所述Chr10-85853737含有如SEQ ID NO.1所示序列第252位的多态性为C/T的核苷酸序列。
3.根据权利要求2所述的SNP分子标记,其特征在于,由序列如SEQ ID NO.2-3所示的引物对以油茶基因组DNA为模板经PCR扩增获得。
4.根据权利要求2-3任一项所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记Chr10-85853737中,具有所述多态性的位点的基因型为C/T,对应于高单果质量;基因型为C/C,对应于低单果质量。
5.用于扩增权利要求2-4任一项所述SNP分子标记的引物。
6.根据权利要求5所述的引物,其特征在于,包括序列如SEQ ID NO.2-3所示的引物。
7.含有权利要求5或6所述的引物的试剂或试剂盒。
8.权利要求1所述的与油茶单果质量相关的DNA片段或权利要求2-4任一项所述的SNP分子标记或权利要求5-6任一项所述的引物或权利要求7所述的试剂或试剂盒的以下任一种应用:
(1)在鉴定油茶果实大小表型中的应用;
(2)在油茶果实质量大小的早期预测中的应用;
(3)在油茶果实质量大小改良或油茶果实质量大小分子标记辅助育种中的应用;
(4)在筛选大果型油茶中的应用。
9.一种鉴定油茶果实质量或筛选高单果质量油茶的方法,其特征在于,包括:
(1)提取待鉴定油茶的基因组DNA;
(2)以基因组DNA为模板,利用序列如SEQ ID NO.2-3所示的引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求2-4任一项所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶单个果实质量的表型;
优选地,步骤(2)中,所述PCR扩增的反应程序为:94-95℃,3-5min;94-95℃,15-30s,65-69℃,40-60s,38-45个循环;67-70℃,3-6min。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述判断待鉴定油茶单个果实质量大小表型的方法为:
若SNP分子标记Chr10-85853737,具有所述多态性的位点的基因型为C/T,则待鉴定油茶为高单果质量;基因型为C/C,则待鉴定油茶为低单果质量。
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