[发明专利]一种类孟买血型FUT1 236delG等位基因及其检测方法和应用在审
申请号: | 202110803637.4 | 申请日: | 2021-07-15 |
公开(公告)号: | CN113667673A | 公开(公告)日: | 2021-11-19 |
发明(设计)人: | 邹洁;沈钢;任明;石小玲;江梦天;何鸣镝 | 申请(专利权)人: | 武汉血液中心 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/11;C12Q1/6858;C12Q1/6881 |
代理公司: | 武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙) 42242 | 代理人: | 朱才永 |
地址: | 430000 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种类 孟买 血型 fut1 236 delg 等位基因 及其 检测 方法 应用 | ||
1.一种类孟买血型FUT1236delG等位基因,其特征在于,所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因为Hh血型系统变异型FUT1基因编码区域由起始密码子第236位碱基缺失了1个G。
2.权利要求1所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因在制备用于检测类孟买血型的制品中的应用。
3.一种用于检测红细胞类孟买血型的引物对,其特征在于,所述的引物对的序列如SEQID NO:1-SEQ ID NO:3所示,其中,针对所述类孟买血型FUT1基因236delG等位基因的引物序列如SEQ ID NO:1所示和SEQ ID NO:2所示,针对野生型FUT1基因的引物序列如SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:2所示,
4.一种用于检测红细胞类孟买血型的制品,其特征在于,所述制品是用于检测待检测的样品是否存权利要求1所述的类孟买血型FUT1 236delG等位基因。
5.根据权利要求4所述的一种用于检测红细胞类孟买血型的制品,其特征在于,所述制品包括PCR扩增测序检测试剂盒,所述PCR扩增测序检测试剂盒包括权利要求3所述的引物对。
6.根据权利要求5所述的一种用于检测红细胞类孟买血型的制品,其特征在于,所述PCR扩增测序检测试剂盒还包括2×Taq PCR MasterMix和内参引物对。
7.一种类孟买血型FUT1236delG等位基因的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括:通过基因扩增方法对包含突变位点的目的片段进行选择性扩增,由此检测该突变基因的有无,检测方法包括以下步骤:
提取待检样本中的基因组DNA;
以所述基因组DNA为模板,采用用于检测红细胞类孟买血型的引物对进行PCR反应,得到PCR反应产物;
利用凝胶电泳法检测所述PCR反应产物的条带格局;
根据所述条带格局判断被检样本是否携带236delG等位基因,并鉴别纯合型或杂合型。
8.根据权利要求7所述的一种类孟买血型FUT1236delG等位基因的检测方法,其特征在于,所述根据所述条带格局判断被检样本是否携带236delG等位基因,并鉴别纯合型或杂合型,具体包括:
若待检测样本的所述条带格局为:没有236delG特异性扩增产物条带,表明待检测样本为非携带者;
若待检测样本的所述条带格局为:有236delG特异性扩增产物条带,表明待检测样本为236delG等位基因携带者;进一步判断236delG等位基因携带者为纯合型或杂合型,包括:
若待检测样本的所述条带格局为:既有236delG特异性扩增产物条带又有440wild特异性扩增产物条带,表明待检测样本为杂合型236delG等位基因携带者;
若待检测样本的所述条带格局为:只有236delG特异性扩增产物条带而没有440wild特异性扩增产物条带,表明待检测样本为纯合型236delG等位基因携带者。
9.根据权利要求7所述类孟买血型FUT1236delG等位基因的检测方法,其特征在于,所述用于检测红细胞类孟买血型的引物对如权利要求3所示,所述236delG特异性扩增产物条带和所述440wild特异性扩增产物条带的长度均为250bp;
同时引入1对管家基因β-actin引物作为DNA样本扩增阳性内参照,所述内参基因引物对的序列如SEQ ID NO:4-NO:5所示,所述内参照扩增产物片段长度为200bp。
10.根据权利要求7所述类孟买血型FUT1236delG等位基因的检测方法,其特征在于,所述236delG等位基因/野生型基因扩增的反应体系总体积10μL,包括DNA模板50ng,正反向引物终浓度各为0.4μM,2×Taq PCR MasterMix 5ul;
所述PCR扩增的条件:95℃预变性2min;95℃变性30s,66℃退火30s,72℃延伸30s,循环35次;最后72℃延伸10min,冷却至4℃。
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