[发明专利]用于筛选VFM群体感应信号淬灭菌和抑制剂的报告系统及其构建方法有效
| 申请号: | 202110772560.9 | 申请日: | 2021-07-08 |
| 公开(公告)号: | CN113416731B | 公开(公告)日: | 2022-11-11 |
| 发明(设计)人: | 周佳暖;胡明;张炼辉;刘帆;吕明发 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/74;C12N1/21;C12N15/65;C12N15/66;G01N21/64;C12R1/01 |
| 代理公司: | 广州智斧知识产权代理事务所(普通合伙) 44649 | 代理人: | 朱双 |
| 地址: | 510642 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 筛选 vfm 群体 感应 信号 灭菌 抑制剂 报告 系统 及其 构建 方法 | ||
1.vfmE启动子,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2的第20-536位所示。
2.一种用于检测Dickeya属VFM群体感应信号的报告系统,其特征在于,所述的报告系统含有报告系统VR2,所述的报告系统VR2包含vfm基因簇和报告质粒,所述的报告质粒是以pPROBE-NT质粒为框架,在GFP基因前插入vfmE启动子得到的,所述的报告质粒包含抗性筛选基因、vfmE启动子及GFP基因,所述的GFP基因在vfmE启动子的控制下表达;所述的vfmE启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.2的第20-536位所示;所述的报告系统VR2是以Dickeyazeae MS2为受体菌,转入报告质粒后得到报告系统VR2。
3.根据权利要求2所述的报告系统,其特征在于,所述的报告系统还含有空白对照系统VR0,所述的空白对照系统VR0是以VFM缺失突变体△vfmE为受体菌,转入报告质粒后得到空白对照系统VR0;所述的报告质粒是以pPROBE-NT质粒为框架,在GFP基因前插入vfmE启动子得到的;所述的vfmE启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.2的第20-536位所示。
4.一种用于检测Dickeya属VFM群体感应信号的报告系统VR2的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
a.以Dickeya zeae MS2基因组DNA为模板,用引物pvfmE-F2和pvfmE-R2进行PCR扩增获得vfmE启动子片段;所述的引物pvfmE-F2为:ctgcaggtcgactctagagccgcaaaacgggctccgcttt,所述的引物pvfmE-R2为:aatctttagttagttaggggtcctgaatcaggttattgtt;
b.将vfmE启动子片段与经BamHI-HF和EcoRI-HF双酶切的pPROBE-NT质粒通过同源重组方式连接,得到重组质粒pVfmEpro2-gfp即为报告质粒;进一步转化E. coli DH5α感受态细胞,阳性克隆经PCR扩增、测序验证得到E. coli DH5α(pVfmEpro2-gfp);
c.将E. coli DH5α(pVfmEpro2-gfp)、E. coli HB101(pRK2013)和Dickeya zeae MS2于LB平板上共培养进行接合重组,然后于含卡那霉素的MM平板筛选培养,挑单菌落PCR扩增验证,成功转入重组质粒pVfmEpro2-gfp的Dickeya zeae MS2菌即为报告系统VR2。
5.权利要求2-3任一项所述的用于检测Dickeya属VFM群体感应信号的报告系统在检测Dickeya属VFM群体感应信号中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,用报告系统VR2检测VFM群体感应信号,用空白对照系统VR0作为空白对照进行校正。
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