[发明专利]一种快速鉴定日本对虾遗传性别的分子标记C42257及其应用

说明书

本发明提供了一种快速鉴定日本对虾遗传性别的分子标记C42257及其应用。所述分子标记C42257的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，用于检测所述的分子标记C42257的引物对的核苷酸序列分别为：C42257F：GGGGGACAA ACAGAGACA和C42257R：ATCGGGGTGGATTTAGAA所述分子标记C42257可以不受日本对虾组织特异性及环境的影响，使用步骤简单，结果明显，将日本对虾的基因组DNA与引物对进行PCR反应后电泳检测，若在183bp处出现条带，则为雌性日本对虾，该分子标记还可以促进日本对虾全雌或高雌苗种培育技术的建立，具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明属于DNA分子标记技术领域，具体涉及一种快速鉴定日本对虾遗传性别的分子标记C42257及其应用。

背景技术

日本对虾（Penaeus japonicus）属甲壳纲、十足目、对虾科、对虾属动物，又称车虾、花虾、花尾虾等，在我国主要分布在江苏以南沿海地区。日本对虾具有生长迅速、抗病力强、干露存活时间长、长途运输成活率高的特点，再因其具有的较高经济价值，且市场价格高，所以是我国沿海地区一种重要的经济对虾种类。在养殖过程中，日本对虾的成熟雌虾要大于雄虾，因此如果能够实现高效的单性养殖，将显著提高日本对虾的养殖经济效益。然而，目前尚没有高效的日本对虾性别控制技术。

分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映。分子标记具有显著的优越性：大多数分子标记为共显性，对隐性性状的选择十分便利；基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；生物发育不同阶段、不同组织的DNA都可用于标记分析；分子标记检测简单、迅速。开发与日本对虾性别鉴定相关的分子标记，可以实现日本对虾的单性育种，提高养殖户的经济收益，对日本对虾的养殖和育种具有重要的意义。

发明内容

本发明提供了一种快速鉴定日本对虾遗传性别的分子标记C42257及其应用。本发明通过比较组学和生物信息学分析方法筛选到性别特异区段，并进而筛选得到一个新的鉴定日本对虾遗传性别分子标记C42257，该分子标记鉴定效率及准确率高，还能够用于全雌或高雌性比日本对虾的苗种培育，有助于日本对虾的养殖发展。

为实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案予以实现：

本发明提供了一种快速鉴定日本对虾遗传性别的分子标记C42257，所述分子标记C42257的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。

本发明还提供了用于检测所述的分子标记C42257的引物对，所述引物对的核苷酸序列为：

C42257F：GGGGGACAAACAGAGACA，

C42257R：ATCGGGGTGGATTTAGAA。

本发明还提供了所述的分子标记C42257在用于快速鉴定日本对虾遗传性别中的应用。

进一步：利用所述分子标记C42257快速鉴定日本对虾遗传性别的步骤如下：

（1）合成核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的引物对C42257F和C42257R；

（2）提取日本对虾样本中的基因组DNA；

（3）以步骤（2）中提取的基因组DNA作为模板，利用引物对C42257F和C42257R进行PCR扩增反应，得到PCR扩增产物；

（4）对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，观察电泳结果；若电泳结果在183bp出现扩增目的条带，则日本对虾为雌性，若电泳结果在183bp处无扩增目的条带出现，则日本对虾为雄性。

进一步：所述步骤（3）中PCR扩增反应的条件为94℃，3min；94℃，30s，55℃，30s，72℃，30s，重复32个循环；72℃，10min。