[发明专利]联合基因组在制备肾透明细胞癌预后评估系统中的应用

权利要求书

1.检测生物样品中联合基因组各基因表达量的试剂在制备肾透明细胞癌预后评估试剂盒中的应用，其特征在于，该联合基因组为NFKBIA、PRKCE、TLR3、BCL2、TAL1、VCAM1、CD36、VEGFA、SAA1、HLA-DOB、CCL19、PDCD1、IL1R2、CARD11、FCGR1A、SOCS1、IL10、GATA3、CASP3、CD22、PMCH、TNFRSF9、CXCL16、TNFRSF11A、CD28、CTAG1B、HNRNPA2B1以及ALKBH5的联合。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：

其中，所述试剂盒包含了检测生物样品中所述联合基因组中各基因表达量的试剂。

3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：

其中，所述的检测生物样品中联合基因组各基因表达量的试剂，选自：对各个基因具有检测特异性的PCR引物，该PCR引物的序列如SEQ ID NO.1～56所示。

4.一种肾透明细胞癌预后评估试剂盒，其特征在于：由逆转录系统、引物系统和扩增系统组成，所述的引物系统包括如SEQ ID NO.1～56所示的PCR引物。

5.一种用于肾透明细胞癌预后评估的检测探针，其特征在于，包括与联合基因组中各基因特异性结合的探针，该联合基因组为NFKBIA、PRKCE、TLR3、BCL2、TAL1、VCAM1、CD36、VEGFA、SAA1、HLA-DOB、CCL19、PDCD1、IL1R2、CARD11、FCGR1A、SOCS1、IL10、GATA3、CASP3、CD22、PMCH、TNFRSF9、CXCL16、TNFRSF11A、CD28、CTAG1B、HNRNPA2B1以及ALKBH5的联合。

6.一种肾透明细胞癌预后评估系统，其特征在于，包括预后评估试剂盒或检测探针以及安装在终端载体上的免疫亚群分类模型，

所述预后评估试剂盒如权利要求4所述，所述检测探针如权利要求5所述；

所述免疫亚群分类模型基于各基因表达量，根据如下公式进行样本分值计算，并根据分值确定当前样本的免疫分型属于免疫排斥型还是免疫荒漠型，

分值＝(-0.662483618)×NFKBIA+(-0.523934558)×PRKCE+(-0.489247682)×TLR3+

(-0.427444142)×BCL2+(-0.350590136)×TAL1+(-0.309081476)×VCAM1+(-0.199916859)×CD36+(-0.144564421)×VEGFA+0.10951554×SAA1+0.117298273×HLA-DOB+0.159836206×CCL19+0.161643026×PDCD1+0.183347864×IL1R2+0.19235162×CARD11+0.194442497×FCGR1A+0.196117825×SOCS1+0.204864528×IL10+0.238322064×GATA3+0.268637578×CASP3+0.28463019×CD22+0.321432354×PMCH+0.340779923×TNFRSF9+0.41874462×CXCL16+0.521498677×TNFRSF11A+0.590391928×CD28+11.36462049×CTAG1B+1.889424×HNRNPA2B1+0.45105321+ALKBH5。

7.根据权利要求6所述的肾透明细胞癌预后评估系统，其特征在于：

其中，所述免疫亚群分类模型为glmnet R软件包，先使用二项式逻辑回归通过机器学习的模式对已有样本进行学习，进行免疫亚群分类，并进行验证。