[发明专利]微生物益生性功能基因的检测方法及其应用

权利要求书

1.微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，包括：构建益生性功能基因数据库，将待测微生物的所有蛋白的序列在所述数据库中进行BLAST比对，根据阈值确定所述待测微生物含有的益生性功能基因；

所述阈值包括BLAST比对的蛋白序列相似度、比对区域覆盖度。

2.根据权利要求1所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述益生性功能基因数据库包括基础氨基酸和维生素合成代谢基因数据库、抗菌活性基因数据库、抗氧化基因数据库、胞外多糖合成基因数据库和降胆固醇基因数据库。

3.根据权利要求1或2所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述基础氨基酸和维生素合成代谢基因数据库包括KEGG代谢通路ID为00730、00740、00750、00760、00770、00780、00785、00790、00830、00250、00260、00270、00290、00300、00220、00330、00340、00350、00360、00380、00400的蛋白序列及其注释信息；

优选地，使用kobas-3.0软件，对所述待测微生物的所有蛋白进行所述基础氨基酸和维生素合成代谢基因数据库中的KEGG代谢通路注释，获得候选氨基酸和维生素代谢相关基因。

4.根据权利要求1～3任一项所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述抗菌活性基因数据库为从Bactibase下载获得的细菌素数据库文件。

5.根据权利要求4所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，在BLAST比对结果中，筛选出蛋白序列相似度≥30％且比对区域覆盖度≥80％的结果，获得候选抗菌活性基因。

6.根据权利要求1～5任一项所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述抗氧化基因数据库包括UniProt蛋白数据库中注释信息中含有关键词SOD、GPx、CAT、HO1、GR、METH的蛋白序列及其注释信息。

7.根据权利要求6所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，在BLAST比对结果中，筛选出蛋白序列相似度≥60％且比对区域覆盖度≥80％的结果，获得候选抗氧化基因。

8.根据权利要求1～7任一项所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述胞外多糖合成基因数据库包括NCBI网站中以exopolysaccharide biosynthesisprotein和tyrosine-protein kinase为关键词收集的蛋白序列及其注释信息；

优选地，在BLAST比对结果中，筛选出蛋白序列相似度≥30％且比对区域覆盖度≥80％的结果，获得候选胞外多糖合成基因。

9.根据权利要求1～8任一项所述的微生物益生性功能基因的检测方法，其特征在于，所述降胆固醇基因数据库包括蛋白数据库UniProt中注释信息中含有关键词Bile salthydrolase的蛋白序列及其注释信息；

优选地，在BLAST比对结果中，筛选出蛋白序列相似度≥60％，且比对区域覆盖度≥80％的结果，获得候选降胆固醇基因。

10.权利要求1～9任一项所述的微生物益生性功能基因的检测方法在益生菌筛选或益生菌功能评价中的应用。